Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02030
- Subject:
- NM_001351593.2
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1152
- Gaps:
- 288
Alignment
Query 1 ATGTCTGCTGAAGTCATCCATCAGGTTGAAGAAGCACTTGATACAGATGAGAAGGAGATGCTGCTCTTTTTGTG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCGGGATGTTGCTATAGATGTGGTTCCACCTAATGTCAGGGACCTTCTGGATATTTTACGGGAAAGAGGTAAGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGTCTGTCGGGGACTTGGCTGAACTGCTCTACAGAGTGAGGCGATTTGACCTGCTCAAACGTATCTTGAAGATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GACAGAAAAGCTGTGGAGACCCACCTGCTCAGGAACCCTCACCTTGTTTCGGACTATAGAGTGCTGATGGCAGA 296
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCAGA 8
Query 297 GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA 82
Query 371 AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA 156
Query 445 CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA 230
Query 519 GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT 304
Query 593 CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA 378
Query 667 CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA 452
Query 741 GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA 526
Query 815 CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT 600
Query 889 GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT 674
Query 963 GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC 748
Query 1037 CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC 822
Query 1111 AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT 896
Query 1185 TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC 970
Query 1259 CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAAGAAAACGCCCACTCCTGGATCTTCACATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAAGAAAACGCCCACTCCTGGATCTTCACATT 1044
Query 1333 GAACTCAATGGCTACATGTATGATTGGAACAGCAGAGTTTCTGCCAAGGAGAAATATTATGTCTGGCTGCAGCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 GAACTCAATGGCTACATGTATGATTGGAACAGCAGAGTTTCTGCCAAGGAGAAATATTATGTCTGGCTGCAGCA 1118
Query 1407 CACTCTGAGAAAGAAACTTATCCTCTCCTACACA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 CACTCTGAGAAAGAAACTTATCCTCTCCTACACA 1152