Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02053
- Subject:
- NM_001286466.1
- Aligned Length:
- 1815
- Identities:
- 1032
- Gaps:
- 666
Alignment
Query 1 ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 ACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 CATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCTGAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 ATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGG 740
|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGTCAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGG 74
Query 741 ATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTT 814
.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 75 CTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTCCTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTT 148
Query 815 ATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATT 888
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATAGAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATC 222
Query 889 CACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCG 962
||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 223 CACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTACTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCG 296
Query 963 AGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACACATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAG 1036
|||||||||.|||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 297 AGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCACACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCG 370
Query 1037 TCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATCATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTA 1110
||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATCATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTA 444
Query 1111 AATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCACCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCAT 1184
|||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 445 AATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCACCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCAT 518
Query 1185 GATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTGCTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGA 1258
||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 519 GATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCGCTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGA 592
Query 1259 GGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGG 1332
||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 593 GGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAATGTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGA 666
Query 1333 GATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTACTTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCAT 1406
||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 667 GATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTACCTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCAT 740
Query 1407 TGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAGTGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAG 1480
.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct 741 CGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGGTGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAG 814
Query 1481 AATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGCCATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGG 1554
|.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 AGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGCCATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGG 888
Query 1555 ATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAAAGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGC 1628
|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 ATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGC 962
Query 1629 AGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGCATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGA 1702
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGCATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGA 1036
Query 1703 TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTCATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCC 1776
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1037 TTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTCATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCG 1110
Query 1777 CCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACATCTCCAGA 1815
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACATCTCCAGA 1149
