Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02053
• Subject: XM_006526607.3
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1649
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTAT---------------------------  47
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||                           
Sbjct    1  ATGGACCCGGCAGAGGCGGTGCTGCAGGAGAAAGCGCTTAAGTTTATGGCTGCAGTTCCGGCTGGTGGATATTG  74

Query   48  ---------------GTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT  106
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGGAATAATAAAAAGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT  148

Query  107  CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT  222

Query  181  AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAG  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACTTACAACAGCTGTGCCAG  296

Query  255  ACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGCTATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAA  328
            .||.|||.||||||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct  297  GCTTTGCATAAACCAAGAGACAGTATGTCTAACAAGCACTGCTATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCA  370

Query  329  AACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAACGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAG  402
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  AACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGCGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAG  444

Query  403  GAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCA  476
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  GAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGATCAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCA  518

Query  477  AATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAAACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTC  550
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  AATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAAACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCAC  592

Query  551  TGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGTCATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCT  624
            |||||||.|||||..||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  593  TGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGTCATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCT  666

Query  625  GAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGCATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGT  698
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGCATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGT  740

Query  699  CAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGGATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTC  772
            ||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGGCTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTC  814

Query  773  CTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTTATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATA  846
            ||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTTATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATA  888

Query  847  GAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATTCACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTA  920
            ||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  889  GAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATCCACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTA  962

Query  921  CTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCGAGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACA  994
            ||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  963  CTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCGAGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCA  1036

Query  995  CATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAGTCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATC  1068
            ||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037  CACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCGTCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATC  1110

Query 1069  ATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTAAATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCA  1142
            ||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  ATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTAAATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCA  1184

Query 1143  CCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTG  1216
            |||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185  CCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCG  1258

Query 1217  CTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGAGGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAAT  1290
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  CTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGAGGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAAT  1332

Query 1291  GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGGGATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTAC  1364
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGAGATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTAC  1406

Query 1365  TTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCATTGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAG  1438
            .||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1407  CTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCATCGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGG  1480

Query 1439  TGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAGAATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGC  1512
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||
Sbjct 1481  TGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAGAGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGC  1554

Query 1513  CATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGGATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAA  1586
            ||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  CATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGGATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAA  1628

Query 1587  AGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGCAGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGC  1660
            |||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1629  AGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGCAGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGC  1702

Query 1661  ATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTC  1734
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  ATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTC  1776

Query 1735  ATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCCCCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACAT  1808
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777  ATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCGCCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACAT  1850

Query 1809  CTCCAGA  1815
            |||||||
Sbjct 1851  CTCCAGA  1857