Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02053
- Subject:
- XM_006526610.3
- Aligned Length:
- 1857
- Identities:
- 1571
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTAT--------------------------- 47
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGACCCGGCAGAGGCGGTGCTGCAGGAGAAAGCGCTTAAGTTTATGGCTGCAGTTCCGGCTGGTGGATATTG 74
Query 48 ---------------GTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT 106
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGGAATAATAAAAAGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT 148
Query 107 CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTC--------------------------- 195
Query 181 AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAG 254
|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 196 ---------------------------------------------------CAGACTTACAACAGCTGTGCCAG 218
Query 255 ACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGCTATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAA 328
.||.|||.||||||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 219 GCTTTGCATAAACCAAGAGACAGTATGTCTAACAAGCACTGCTATGAAGACTGAAAATTGTGTGGCCAAAGCCA 292
Query 329 AACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAACGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAG 402
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 293 AACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGCGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAG 366
Query 403 GAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCA 476
||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 367 GAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGATCAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCA 440
Query 477 AATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAAACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTC 550
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 441 AATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAAACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCAC 514
Query 551 TGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGTCATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCT 624
|||||||.|||||..||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 515 TGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGTCATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCT 588
Query 625 GAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGCATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGT 698
||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 589 GAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGCATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGT 662
Query 699 CAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGGATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTC 772
||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 663 CAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGGCTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTC 736
Query 773 CTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTTATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATA 846
||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 737 CTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTTATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATA 810
Query 847 GAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATTCACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTA 920
||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 811 GAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATCCACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTA 884
Query 921 CTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCGAGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACA 994
||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 885 CTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCGAGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCA 958
Query 995 CATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAGTCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATC 1068
||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 959 CACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCGTCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATC 1032
Query 1069 ATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTAAATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCA 1142
||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1033 ATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTAAATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCA 1106
Query 1143 CCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTG 1216
|||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1107 CCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCG 1180
Query 1217 CTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGAGGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAAT 1290
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1181 CTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGAGGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAAT 1254
Query 1291 GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGGGATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTAC 1364
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1255 GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGAGATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTAC 1328
Query 1365 TTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCATTGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAG 1438
.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1329 CTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCATCGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGG 1402
Query 1439 TGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAGAATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGC 1512
||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||
Sbjct 1403 TGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAGAGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGC 1476
Query 1513 CATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGGATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAA 1586
||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1477 CATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGGATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAA 1550
Query 1587 AGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGCAGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGC 1660
|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1551 AGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGCAGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGC 1624
Query 1661 ATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTC 1734
||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1625 ATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTC 1698
Query 1735 ATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCCCCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACAT 1808
||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1699 ATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCGCCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACAT 1772
Query 1809 CTCCAGA 1815
|||||||
Sbjct 1773 CTCCAGA 1779