Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02053
• Subject: XM_011247119.2
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1569
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  ATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGGCACTCAAGTTTAT---------------------------  47
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||                           
Sbjct    1  ATGGACCCGGCAGAGGCGGTGCTGCAGGAGAAAGCGCTTAAGTTTATGGCTGCAGTTCCGGCTGGTGGATATTG  74

Query   48  ---------------GTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT  106
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGGAATAATAAAAAGTGCTCTATGCCCAGGTCTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCCTT  148

Query  107  CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTCACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGT  222

Query  181  AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAG  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||  
Sbjct  223  AATAATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTCACTTAGACAG---------------GCC--  279

Query  255  ACTCTGCTTAAACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGCTATGAAGACTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAA  328
                                                                                     |
Sbjct  280  -------------------------------------------------------------------------A  280

Query  329  AACTTGCCAATGGCACTTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAACGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAAAAGGAAAAG  402
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  281  AACTTGCCAATGGCACTTCCAGCATGATTGTGCCCAAGCAGCGGAAACTCTCAGCAAGCTATGAGAAGGAAAAG  354

Query  403  GAACTGTGTGTCAAATACTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATATCCCA  476
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  355  GAGCTGTGTGTCAAGTATTTTGAGCAGTGGTCAGAGTCTGATCAAGTGGAATTTGTAGAACACCTTATATCCCA  428

Query  477  AATGTGTCATTACCAACATGGGCACATAAACTCGTATCTTAAACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAACTGCTC  550
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  429  AATGTGTCACTACCAGCATGGGCACATCAACTCCTACCTAAAACCTATGCTGCAGAGGGATTTCATAACTGCAC  502

Query  551  TGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAACATTCTGTCATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCT  624
            |||||||.|||||..||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  503  TGCCAGCACGGGGTCTGGACCACATCGCTGAGAACATTCTGTCATACTTGGACGCCAAGTCACTGTGTGCTGCT  576

Query  625  GAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATGGCATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGT  698
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  577  GAGCTCGTGTGCAAGGAATGGTACCGCGTGACGTCGGACGGCATGCTGTGGAAAAAGCTCATCGAGAGGATGGT  650

Query  699  CAGGACAGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGGATGGGGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTC  772
            ||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  651  CAGGACGGACTCTCTGTGGCGAGGCCTGGCAGAGCGCAGAGGCTGGGGACAGTACTTATTCAAAAACAAACCTC  724

Query  773  CTGACGGGAATGCTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTTATCCTAAAATTATACAAGACATTGAGACAATA  846
            ||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CTGATGAGAACGCTCCTCCCAACTCCTTTTATAGAGCGCTTTATCCTAAAATCATACAAGACATTGAGACAATA  798

Query  847  GAATCTAATTGGAGATGTGGAAGACATAGTTTACAGAGAATTCACTGCCGAAGTGAAACAAGCAAAGGAGTTTA  920
            ||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  799  GAGTCCAATTGGAGATGTGGGCGACATAGTTTACAGAGAATCCACTGCCGGAGTGAAACAAGTAAAGGGGTTTA  872

Query  921  CTGTTTACAGTATGATGATCAGAAAATAGTAAGCGGCCTTCGAGACAACACAATCAAGATCTGGGATAAAAACA  994
            ||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  873  CTGTTTACAGTACGACGACCAGAAGATAGTCAGCGGCCTTCGAGACAACACCATCAAGATCTGGGATAAAAGCA  946

Query  995  CATTGGAATGCAAGCGAATTCTCACAGGCCATACAGGTTCAGTCCTCTGTCTCCAGTATGATGAGAGAGTGATC  1068
            ||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  947  CACTGGAATGCAAGCGGATTCTCACGGGCCACACGGGCTCCGTCCTGTGTCTGCAGTACGATGAGAGGGTGATC  1020

Query 1069  ATAACAGGATCATCGGATTCCACGGTCAGAGTGTGGGATGTAAATACAGGTGAAATGCTAAACACGTTGATTCA  1142
            ||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1021  ATCACAGGCTCCTCAGACTCCACCGTCAGAGTGTGGGATGTAAATGCAGGTGAGATGCTAAACACATTGATTCA  1094

Query 1143  CCATTGTGAAGCAGTTCTGCACTTGCGTTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGCTCCAAAGATCGTTCCATTG  1216
            |||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1095  CCACTGTGAAGCCGTTCTGCACCTGCGCTTCAATAATGGCATGATGGTGACCTGTTCCAAAGACCGTTCCATCG  1168

Query 1217  CTGTATGGGATATGGCCTCCCCAACTGACATTACCCTCCGGAGGGTGCTGGTCGGACACCGAGCTGCTGTCAAT  1290
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1169  CTGTGTGGGATATGGCTTCCCCAACTGACATCACCCTCAGGAGGGTGCTGGTGGGACACCGAGCTGCGGTCAAT  1242

Query 1291  GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATTGTTTCTGCATCTGGGGATAGAACTATAAAGGTATGGAACACAAGTAC  1364
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1243  GTTGTAGACTTTGATGACAAGTACATCGTTTCTGCCTCTGGAGATAGAACCATAAAGGTGTGGAACACAAGTAC  1316

Query 1365  TTGTGAATTTGTAAGGACCTTAAATGGACACAAACGAGGCATTGCCTGTTTGCAGTACAGGGACAGGCTGGTAG  1438
            .||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1317  CTGTGAATTCGTAAGGACCCTAAATGGGCACAAGCGTGGCATCGCCTGTTTGCAGTACAGAGACAGGCTGGTGG  1390

Query 1439  TGAGTGGCTCATCTGACAACACTATCAGATTATGGGACATAGAATGTGGTGCATGTTTACGAGTGTTAGAAGGC  1512
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||
Sbjct 1391  TGAGCGGCTCCTCTGACAACACCATCAGGCTGTGGGACATAGAGTGTGGAGCATGCCTGCGAGTGTTGGAGGGC  1464

Query 1513  CATGAGGAATTGGTGCGTTGTATTCGATTTGATAACAAGAGGATAGTCAGTGGGGCCTATGATGGAAAAATTAA  1586
            ||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1465  CATGAGGAGTTGGTACGCTGCATTCGATTTGATAACAAAAGGATAGTGAGCGGAGCCTATGATGGGAAAATTAA  1538

Query 1587  AGTGTGGGATCTTGTGGCTGCTTTGGACCCCCGTGCTCCTGCAGGGACACTCTGTCTACGGACCCTTGTGGAGC  1660
            |||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1539  AGTGTGGGATCTTATGGCTGCTTTGGACCCGCGTGCTCCAGCAGGGACTCTCTGTCTGCGGACACTTGTGGAGC  1612

Query 1661  ATTCCGGAAGAGTTTTTCGACTACAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATCCTC  1734
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1613  ATTCTGGAAGAGTTTTCCGCCTCCAGTTTGATGAATTCCAGATTGTCAGTAGTTCACATGATGACACAATTCTC  1686

Query 1735  ATCTGGGACTTCCTAAATGATCCAGCTGCCCAAGCTGAACCCCCCCGTTCCCCTTCTCGAACATACACCTACAT  1808
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1687  ATCTGGGACTTCCTGAATGATCCAGCTGCTCACGCTGAACCGCCCCGCTCCCCTTCTCGGACATACACCTACAT  1760

Query 1809  CTCCAGA  1815
            |||||||
Sbjct 1761  CTCCAGA  1767