Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02125
• Subject: NR_103804.2
• Aligned Length: 1911
• Identities: 1371
• Gaps: 540

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTCAGAACACTGGCGGCCGATCCCAACGAGGCTCCCTGGAGCCCGACGCAGAGCAGCGCCCTGGCCGGGCCAAG  74

Query    1  --------------ATGGATTCCTTCAAAGTAGTGCTGGAGGGGCCAGCACCTTGGGGCTTCCGGCTGCAAGGG  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGAGCCGGCATCATGGATTCCTTCAAAGTAGTGCTGGAGGGGCCAGCACCTTGGGGCTTCCGGCTGCAAGGG  148

Query   61  GGCAAGGACTTCAATGTGCCCCTCTCCATTTCCCGGCTCACTCCTGGGGGCAAAGCGGCGCAGGCCGGAGTGGC  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCAAGGACTTCAATGTGCCCCTCTCCATTTCCCGGCTCACTCCTGGGGGCAAAGCGGCGCAGGCCGGAGTGGC  222

Query  135  CGTGGGTGACTGGGTGCTGAGCATCGATGGCGAGAATGCGGGTAGCCTCACACACATCGAAGCTCAGAACAAGA  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGTGGGTGACTGGGTGCTGAGCATCGATGGCGAGAATGCGGGTAGCCTCACACACATCGAAGCTCAGAACAAGA  296

Query  209  TCCGGGCCTGCGGGGAGCGCCTCAGCCTGGGCCTCAGCAGGGCCCAGCCGGTTCAGAGCAAACCGCAGAAGGCC  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCGGGCCTGCGGGGAGCGCCTCAGCCTGGGCCTCAGCAGGGCCCAGCCGGTTCAGAGCAAACCGCAGAAGGCC  370

Query  283  TCCGCCCCCGCCGCGGACCCTCCGCGGTACACCTTTGCACCCAGCGTCTCCCTCAACAAGACGGCCCGGCCCTT  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCGCCCCCGCCGCGGACCCTCCGCGGTACACCTTTGCACCCAGCGTCTCCCTCAACAAGACGGCCCGGCCCTT  444

Query  357  TGGGGCGCCCCCGCCCGCTGACAGCGCCCCGCAGCAGAATGGACAGCCGCTCCGACCGCTGGTCCCAGATGCCA  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGGGCGCCCCCGCCCGCTGACAGCGCCCCGCAGCAGAATGGACAGCCGCTCCGACCGCTGGTCCCAGATGCCA  518

Query  431  GCAAGCAGCGGCTGATGGAGAACACAGAGGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCGCGTTCCTTCCGC  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAAGCAGCGGCTGATGGAGAACACAGAGGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCGCGTTCCTTCCGC  592

Query  505  ATCCTTGCCCACCTCACAGGCACCGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAGCACCTGAAGAAATCA--------  570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  593  ATCCTTGCCCACCTCACAGGCACCGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAGCACCTGAAGAAATCAAGCTAGAG  666

Query  571  --------------------------------------------------------------------------  570
                                                                                      
Sbjct  667  ACCGCACACCAGCTAACTGGACATTGCTAGGAGAAGCTGCCCTTCCCATCCCTACCCCAGTGGGACCTGGAATC  740

Query  571  --------------------------------------------------------------------------  570
                                                                                      
Sbjct  741  CAACTCGGCAGTTTCCACGCCCCCAGTCATCTCCCGTGGGGCCAGCAGGACCCAGGTTGGGGGGTGGGGCCATG  814

Query  571  -------------------------------------------AGCCAGGTGCCCAGGACAGAAGCCCCAGCCC  601
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAGGAAGCTCAGCCATGCAGGGCCTTGAATGGCAGATCTTGCAGCCAGGTGCCCAGGACAGAAGCCCCAGCCC  888

Query  602  CAGCCTCATCTACACCCCAGGAGCCCTGGCCTGGCCCTACCGCCCCCAGCCCTACCAGCCGCCCGCCCTGGGCT  675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCCTCATCTACACCCCAGGAGCCCTGGCCTGGCCCTACCGCCCCCAGCCCTACCAGCCGCCCGCCCTGGGCT  962

Query  676  GTGGACCCTGCGTTTGCCGAGCGCTATGCCCCGGACAAAACGAGCACAGTGCTGACCCGGCACAGCCAGCCGGC  749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGGACCCTGCGTTTGCCGAGCGCTATGCCCCGGACAAAACGAGCACAGTGCTGACCCGGCACAGCCAGCCGGC  1036

Query  750  CACGCCCACGCCGCTGCAGAGCCGCACCTCCATTGTGCAGGCAGCTGCCGGAGGGGTGCCAGGAGGGGGCAGCA  823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACGCCCACGCCGCTGCAGAGCCGCACCTCCATTGTGCAGGCAGCTGCCGGAGGGGTGCCAGGAGGGGGCAGCA  1110

Query  824  ACAACGGCAAGACTCCCGTGTGTCACCAGTGCCACAAGGTCATCCGGGGCCGCTACCTGGTGGCGCTGGGCCAC  897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAACGGCAAGACTCCCGTGTGTCACCAGTGCCACAAGGTCATCCGGGGCCGCTACCTGGTGGCGCTGGGCCAC  1184

Query  898  GCGTACCACCCGGAGGAGTTTGTGTGTAGCCAGTGTGGGAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCTTTGAGGAGAA  971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCGTACCACCCGGAGGAGTTTGTGTGTAGCCAGTGTGGGAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCTTTGAGGAGAA  1258

Query  972  GGGCGCCATCTTCTGCCCACCATGCTATGACGTGCGCTATGCACCCAGCTGTGCCAAGTGCAAGAAGAAGATTA  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGCGCCATCTTCTGCCCACCATGCTATGACGTGCGCTATGCACCCAGCTGTGCCAAGTGCAAGAAGAAGATTA  1332

Query 1046  CAGGCGAGATCATGCACGCCCTGAAGATGACCTGGCACGTGCACTGCTTTACCTGTGCTGCCTGCAAGACGCCC  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGGCGAGATCATGCACGCCCTGAAGATGACCTGGCACGTGCACTGCTTTACCTGTGCTGCCTGCAAGACGCCC  1406

Query 1120  ATCCGGAACAGGGCCTTCTACATGGAGGAGGGCGTGCCCTATTGCGAGCGAGACTATGAGAAGATGTTTGGCAC  1193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATCCGGAACAGGGCCTTCTACATGGAGGAGGGCGTGCCCTATTGCGAGCGAGACTATGAGAAGATGTTTGGCAC  1480

Query 1194  GAAATGCCATGGCTGTGACTTCAAGATCGACGCTGGGGACCGCTTCCTGGAGGCCCTGGGCTTCAGCTGGCATG  1267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAAATGCCATGGCTGTGACTTCAAGATCGACGCTGGGGACCGCTTCCTGGAGGCCCTGGGCTTCAGCTGGCATG  1554

Query 1268  ACACCTGCTTCGTCTGTGCGATATGTCAGATCAACCTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAAGGACAGGCCT  1341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACACCTGCTTCGTCTGTGCGATATGTCAGATCAACCTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAAGGACAGGCCT  1628

Query 1342  CTCTGCAAGAGCCATGCCTTCTCTCATGTG--------------------------------------------  1371
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1629  CTCTGCAAGAGCCATGCCTTCTCTCATGTGTGAGCCCCTTCTGCCCACAGCTGCCGCGGTGGCCCCTAGCCTGA  1702

Query 1372  --------------------------------------------------------------------------  1371
                                                                                      
Sbjct 1703  GGGGCCTGGAGTCGTGGCCCTGCATTTCTGGGTAGGGCTGGCAATGGTTGCCTTAACCCTGGCTCCTGGCCCGA  1776

Query 1372  --------------------------------------------------------------------------  1371
                                                                                      
Sbjct 1777  GCCTGGGGCTCCCTGGGCCCTGCCCCACCCACCTTATCCTCCCACCCCACTCCCTCCACCACCACAGCACACCG  1850

Query 1372  -------------------------------------------------------------  1371
                                                                         
Sbjct 1851  GTGCTGGCCACACCAGCCCCCTTTCACCTCCAGTGCCACAATAAACCTGTACCCAGCTGTG  1911