Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02125
• Subject: XM_006517344.3
• Aligned Length: 1372
• Identities: 1129
• Gaps: 104

Alignment

Query    1  ATGGATTCCTTCAAAGTAGTGCTGGAGGGGCCAGCACCTTGGGGCTTCCGGCTGCAAGGGGGCAAGGACTTCAA  74
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTCCTTCAAGGTGGTGCTGGAAGGGCCAGCCCCTTGGGGCTTCCGTCTGCAAGGGGGCAAGGACTTCAA  74

Query   75  TGTGCCCCTCTCCATTTCCCGGCTCACTCCTGGGGGCAAAGCGGCGCAGGCCGGAGTGGCCGTGGGTGACTGGG  148
            ||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  TGTGCCCCTCTCTATCTCTCGGCTCACGCCCGGAGGCAAAGCTGCACAGGCCGGTGTGGCTGTGGGAGACTGGG  148

Query  149  TGCTGAGCATCGATGGCGAGAATGCGGGTAGCCTCACACACATCGAAGCTCAGAACAAGATCCGGGCCTGCGGG  222
            |.||||..||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  TACTGAATATTGACGGTGAGAACGCGGGCAGCCTCACGCACATCGAAGCCCAGAACAAGATCCGCGCCTGTGGG  222

Query  223  GAGCGCCTCAGCCTGGGCCTCAGCAGGGCCCAGCCGGTTCAGAGCAAACCGCAGAAGGCCTCCGCCCCCGCCGC  296
            |||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||                
Sbjct  223  GAGCGCCTCAGCCTGGGTCTTAGCAGAGCCCAGCCTGTTCAGAGCAAACCACAGAAGG----------------  280

Query  297  GGACCCTCCGCGGTACACCTTTGCACCCAGCGTCTCCCTCAACAAGACGGCCCGGCCCTTTGGGGCGCCCCCGC  370
                                 ||||                                               |.
Sbjct  281  ---------------------TGCA-----------------------------------------------GA  286

Query  371  CCGCTGACAGCGCCCCGCAGCAGAATGGACAGCCGCTCCGACCGCTGGTCCCAGATGCCAGCAAGCAGCGGCTG  444
            ||.||||||                  .||||..||||.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  287  CCTCTGACA------------------AACAGTTGCTCAGACAGCCGGTCCCCGATGCCAGCAAGCAGCGGCTG  342

Query  445  ATGGAGAACACAGAGGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCGCGTTCCTTCCGCATCCTTGCCCACCT  518
            ||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  ATGGAGGATACCGAAGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCCCGCTCCTTCCGCATCCTTGCCCACCT  416

Query  519  CACAGGCACCGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAGCACCTGAAGAAATCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAAG  592
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||...|.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CACGGGCACAGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAATTCATGAAGAAGTCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAAG  490

Query  593  CCCCAGCCCCAGCCTCATCTACACCCCAGGAGCCCTGGCCTGGCCCTACCGCCCCCAGCCCTACCAGCCGCCCG  666
            |||||||||||||||||.|||.|||||||||..|||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  491  CCCCAGCCCCAGCCTCAACTATACCCCAGGAATCCTGGCCTGGCCCCACCACTCCCAGCCCCACCAGCCGCCCA  564

Query  667  CCCTGGGCTGTGGACCCTGCGTTTGCCGAGCGCTATGCCCCGGACAAAACGAGCACAGTGCTGACCCGGCACAG  740
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  CCCTGGGCTGTGGATCCTGCATTTGCTGAGCGCTATGCCCCAGACAAAACCAGCACAGTGCTGACCCGGCACAG  638

Query  741  CCAGCCGGCCACGCCCACGCCGCTGCAGAGCCGCACCTCCATTGTGCAGGCAGCTGCCGGAGGGGTGC-CAGGA  813
            ||||||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||| || |||||
Sbjct  639  CCAGCCAGCCACACCCACGCCTCTGCAGAACCGCACCTCCATAGTGCAGGCCGCAGCTGGAGGGG-GCACAGGA  711

Query  814  GGGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCCGTGTGTCACCAGTGCCACAAGGTCATCCGGGGCCGCTACCTGGTGGC  887
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  712  GGGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCTGTATGCCACCAGTGCCACAAGATCATCCGCGGCCGCTACCTGGTAGC  785

Query  888  GCTGGGCCACGCGTACCACCCGGAGGAGTTTGTGTGTAGCCAGTGTGGGAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCT  961
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  ACTGGGCCACGCATACCATCCCGAGGAGTTTGTGTGCAGCCAGTGTGGAAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCT  859

Query  962  TTGAGGAGAAGGGCGCCATCTTCTGCCCACCATGCTATGACGTGCGCTATGCACCCAGCTGTGCCAAGTGCAAG  1035
            |.|||||||||||.||.|||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  860  TCGAGGAGAAGGGAGCTATCTTTTGCCCCTCCTGCTATGATGTGCGCTATGCACCCAACTGTGCCAAATGCAAG  933

Query 1036  AAGAAGATTACAGGCGAGATCATGCACGCCCTGAAGATGACCTGGCACGTGCACTGCTTTACCTGTGCTGCCTG  1109
            ||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  934  AAGAAGATCACTGGAGAGATCATGCATGCTCTGAAGATGACCTGGCACGTCCATTGCTTCACCTGTGCTGCCTG  1007

Query 1110  CAAGACGCCCATCCGGAACAGGGCCTTCTACATGGAGGAGGGCGTGCCCTATTGCGAGCGAGACTATGAGAAGA  1183
            |||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  CAAAACGCCAATTCGCAACAGAGCCTTTTACATGGAAGAAGGGGCCCCCTACTGCGAGCGAGACTATGAGAAGA  1081

Query 1184  TGTTTGGCACGAAATGCCATGGCTGTGACTTCAAGATCGACGCTGGGGACCGCTTCCTGGAGGCCCTGGGCTTC  1257
            ||||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1082  TGTTTGGCACAAAATGTCGAGGCTGTGACTTCAAGATTGATGCTGGAGACCGCTTCCTGGAAGCGCTGGGCTTC  1155

Query 1258  AGCTGGCATGACACCTGCTTCGTCTGTGCGATATGTCAGATCAACCTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAA  1331
            ||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  AGCTGGCATGACACATGCTTTGTTTGCGCAATATGTCAGATCAACTTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAA  1229

Query 1332  GGACAGGCCTCTCTGCAAGAGCCATGCCTTCTCTCATGTG  1371
            |||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1230  GGACAAGCCCCTCTGCAAGAGCCACGCCTTCTCTCACGTA  1269