Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02214
• Subject: NM_001204424.2
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1416
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT  74

Query   75  TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA  148

Query  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222

Query  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA  296

Query  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT  370

Query  371  GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG  444

Query  445  GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518

Query  519  AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG  592

Query  593  CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT  666

Query  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA  740

Query  741  TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA  814

Query  815  TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT  888

Query  889  GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT  962

Query  963  GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCTTTCGATGAGATATTGAAGGACCAGGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCTTTCGATGAGATATTGAAGGACCAGGTGG  1036

Query 1037  GGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCTGGCTGTCCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCTGGCTGTCCAA  1110

Query 1111  GATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTCTGGCTCCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTCTGGCTCCAGG  1184

Query 1185  GGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT  1258

Query 1259  ATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTCCGGTCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTCCGGTCA  1332

Query 1333  AATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAA---------------------------------------  1367
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 1333  AATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAAGCCAGAAAGTGAGCAAGGTCGTAGAACTTCCCTAGAAAA  1406

Query 1368  ---------------GGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTCACGGGCCTGATGCAGTCCTCC  1416
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTCACTCGCAGTGTGGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTCACGGGCCTGATGCAGTCCTCC  1470