Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02227
- Subject:
- NM_001195555.2
- Aligned Length:
- 1929
- Identities:
- 1875
- Gaps:
- 54
Alignment
Query 1 ATGTTGAACATGTGGAAGGTGCGCGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTTGTTATGAATTATTCAGAGATCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTGAACATGTGGAAGGTGCGCGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTTGTTATGAATTATTCAGAGATCGA 74
Query 75 GTCTAAGGTTCGAGAGGCAACGAACGATGATCCTTGGGGACCTTCTGGGCAACTCATGGGAGAGATTGCCAAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTAAGGTTCGAGAGGCAACGAACGATGATCCTTGGGGACCTTCTGGGCAACTCATGGGAGAGATTGCCAAGG 148
Query 149 CTACATTTATGTATGAACAATTTCCAGAACTTATGAACATGCTTTGGTCACGAATGTTAAAAGACAACAAAAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTACATTTATGTATGAACAATTTCCAGAACTTATGAACATGCTTTGGTCACGAATGTTAAAAGACAACAAAAAG 222
Query 223 AATTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGGAATGGATCAGAGCGTGTTGTTAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGGAATGGATCAGAGCGTGTTGTTAC 296
Query 297 AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTACGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGTAAGGATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTACGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGTAAGGATC 370
Query 371 AAGGTATAAATATTCGACAGAAGGTGAAGGAATTGGTTGAATTTGCCCAGGATGACGACAGGCTTCGTGAAGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGGTATAAATATTCGACAGAAGGTGAAGGAATTGGTTGAATTTGCCCAGGATGACGACAGGCTTCGTGAAGAG 444
Query 445 CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTTGGGGTTTCCTCAGACAGTGTTGGAGGATTCAGATACAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTTGGGGTTTCCTCAGACAGTGTTGGAGGATTCAGATACAG 518
Query 519 TGAAAGATATGATCCTGAGCCCAAATCAAAATGGGATGAGGAGTGGGATAAAAACAAGAGTGCTTTTCCATTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAAGATATGATCCTGAGCCCAAATCAAAATGGGATGAGGAGTGGGATAAAAACAAGAGTGCTTTTCCATTCA 592
Query 593 GTGATAAATTAGGTGAGCTGAGTGATAAAATTGGAAGCACAATTGATGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGATAAATTAGGTGAGCTGAGTGATAAAATTGGAAGCACAATTGATGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA 666
Query 667 GATAGAGAAGACTCTCCAGAAAGATGCAGCGACAGCGATGAGGAAAAGAAAGCGAGAAGAGGCAGATCTCCCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATAGAGAAGACTCTCCAGAAAGATGCAGCGACAGCGATGAGGAAAAGAAAGCGAGAAGAGGCAGATCTCCCAA 740
Query 741 AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAGACTGTGACGACAAAGCATATTCATATCACACAGGCCACAGAGACCACCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAGACTGTGACGACAAAGCATATTCATATCACACAGGCCACAGAGACCACCA 814
Query 815 CAACCAGACACAAGCGCACAGCAAATCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACAGGGGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAACCAGACACAAGCGCACAGCAAATCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACAGGGGAC 888
Query 889 AAAGCAAGTCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACACCTCAGTCTTCAGTTAAGACTTCAGTGCCTAGCAGCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGCAAGTCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACACCTCAGTCTTCAGTTAAGACTTCAGTGCCTAGCAGCAA 962
Query 963 GTCATCTGGTGACCTTGTTGATCTGTTTGATGGCACCAGCCAGTCAACAGGAGGATCAGCTGATTTATTCGGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTCATCTGGTGACCTTGTTGATCTGTTTGATGGCACCAGCCAGTCAACAGGAGGATCAGCTGATTTATTCGGAG 1036
Query 1037 GATTTGCTGACTTTGGCTCAGCTGCTGCATCAGGCAGTTTCCCTTCCCAAGTAACAGCAACAAGTGGGAATGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATTTGCTGACTTTGGCTCAGCTGCTGCATCAGGCAGTTTCCCTTCCCAAGTAACAGCAACAAGTGGGAATGGA 1110
Query 1111 GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTTGCTTCCAGTGGCGAGTTCTTTGGCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTTGCTTCCAGTGGCGAGTTCTTTGGCAG 1184
Query 1185 TGCCTCACAGCCAGCGGTAGAACTTGTTAGTGGCTCACAATCAGCTCTAGGCCCACCTCCTGCTGCCTCAAATT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCTCACAGCCAGCGGTAGAACTTGTTAGTGGCTCACAATCAGCTCTAGGCCCACCTCCTGCTGCCTCAAATT 1258
Query 1259 CTTCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCGTCCCAGGCAACCATGACATCTTCCCAGAGTATGAATTTCTCTATG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTTCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCGTCCCAGGCAACCATGACATCTTCCCAGAGTATGAATTTCTCTATG 1332
Query 1333 ATGAGCACTAACACTGTGGGACTTGGTTTGCCTATGTCAAGATCA----------------------------- 1377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGAGCACTAACACTGTGGGACTTGGTTTGCCTATGTCAAGATCACAGCCTTTGCAAAATGTTAGCACAGTGCT 1406
Query 1378 -------------------------CAGAATACAGATATGGTCCAGAAATCAGTCAGCAAAACCTTGCCCTCTA 1426
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCAGAAGCCTAATCCTCTCTATAATCAGAATACAGATATGGTCCAGAAATCAGTCAGCAAAACCTTGCCCTCTA 1480
Query 1427 CTTGGTCTGACCCCAGTGTAAACATCAGCCTAGACAACTTACTACCTGGTATGCAGCCTTCCAAACCCCAGCAG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTTGGTCTGACCCCAGTGTAAACATCAGCCTAGACAACTTACTACCTGGTATGCAGCCTTCCAAACCCCAGCAG 1554
Query 1501 CCATCACTGAATACAATGATTCAGCAACAGAATATGCAGCAGCCTATGAATGTGATGACTCAAAGTTTTGGAGC 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCATCACTGAATACAATGATTCAGCAACAGAATATGCAGCAGCCTATGAATGTGATGACTCAAAGTTTTGGAGC 1628
Query 1575 TGTGAACCTCAGTTCTCCATCGAACATGCTTCCTGTCCGGCCCCAAACTAATGCTTTGATAGGGGGACCCATGC 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGTGAACCTCAGTTCTCCATCGAACATGCTTCCTGTCCGGCCCCAAACTAATGCTTTGATAGGGGGACCCATGC 1702
Query 1649 CTATGAGCATGCCCAATGTGATGACTGGCACCATGGGAATGGCCCCTCTTGGAAATACTCCGATGATGAACCAG 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTATGAGCATGCCCAATGTGATGACTGGCACCATGGGAATGGCCCCTCTTGGAAATACTCCGATGATGAACCAG 1776
Query 1723 AGCATGATGGGCATGAACATGAACATAGGGATGTCCGCTGCTGGGATGGGCTTGACAGGCACAATGGGAATGGG 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGCATGATGGGCATGAACATGAACATAGGGATGTCCGCTGCTGGGATGGGCTTGACAGGCACAATGGGAATGGG 1850
Query 1797 CATGCCCAACATAGCCATGACTTCTGGAACTGTGCAACCCAAGCAAGATGCCTTTGCAAATTTCGCCAATTTTA 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CATGCCCAACATAGCCATGACTTCTGGAACTGTGCAACCCAAGCAAGATGCCTTTGCAAATTTCGCCAATTTTA 1924
Query 1871 GCAAA 1875
|||||
Sbjct 1925 GCAAA 1929