Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02232
• Subject: XM_006496721.3
• Aligned Length: 2426
• Identities: 2117
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGATGGACTCCCCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGA  74
            ||||....|||||||||||||||.|..||||.|||||||||.||||...||.|.||||..|||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGACCAGCTCCCCGTTCCTGGATCCCTGGCCGTCCAAGGCTGTGTTTGTCCGTGAGCGCCTGGGTCTTGGCGA  74

Query   75  CCGGCCCAACGACTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCA  148
            .||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  ACGTCCCAATGACTCCTATTGCTACAACTCAGCCAAAAACAGCACTGTGCTCCAAGGGGTCACCTTTGGAGGCA  148

Query  149  TCCCCACTGTCCTGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGA  222
            |||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||..|||||.||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  149  TCCCCACTGTCCTGCTCTTAGATGTCAGTTGCTTTCTGTTTCTAATCCTGGTGTTTTCCATCATAAGGAGAAGA  222

Query  223  TTCTGGGACTATGGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGAC  296
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.|||.||||.||.||||||.||||.|   |
Sbjct  223  TTCTGGGATTATGGCCGCATAGCCCTGGTATCAGAAGCAGGCAGTGAGGCCAGGTTCCAGAGACTGTCCT---C  293

Query  297  TTCCTCCTCAGGTCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGC  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  294  TTCCTCCTCAGGGCAACAAGACTTTGAAAACGAGCTGGGATGCTGTCCTTGGCTGACGGCCATCTTCCGCCTGC  367

Query  371  ATGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC  444
            ||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  368  ATGACGACCAGATCCTGGAGTGGTGCGGAGAGGACGCCATCCACTACCTGTCTTTTCAGAGGCACATCATCTTC  441

Query  445  CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAA  518
            |||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||||..||
Sbjct  442  CTGCTGGTGGTGATCAGCTTCTTGTCCCTGTGTGTCATCTTGCCTGTCAACCTCTCGGGAGACTTGCTGGGTAA  515

Query  519  AGACCCGTATAGTTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCA  592
            ||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..
Sbjct  516  AGACCCTTACAGCTTTGGGAGGACAACGATAGCTAACCTGCAGACTGACAATGACCTCCTCTGGCTGCACACTG  589

Query  593  TCTT-TGCTGTCATTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGA  665
            |||| .|| |||||.||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|.||||||.|..||||||||
Sbjct  590  TCTTCAGC-GTCATCTACCTCTTCCTCACGGTGGGCTTCATGTGGCATCACACACGGTCCATCAGATACAAAGA  662

Query  666  GGAGAACCTGGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCC  739
            |||||..||||||||.|..|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  663  GGAGAGTCTGGTGAGACAAACCTTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGAAGCCAGAAAGGAGACTGTGGAGAGCC  736

Query  740  ACTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTAC  813
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.||||||.||.|||||||||
Sbjct  737  ACTTCCGAGATGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTGGATGTCCAGCTGTGCTACAGCGTGGCTAAGCTGATCTAC  810

Query  814  CTGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCG  887
            ||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||
Sbjct  811  CTGTGCAAAGAGAGAAAGAAGACCGAGAAGAGCCTTACCTATTACACAAACCTGCAGGCGAAGACAGGCCGACG  884

Query  888  GACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCA  961
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.|||.||||||.|||||||.||.|
Sbjct  885  GACCCTCATCAACCCCAAGCCTTGTGGCCAGTTCTGCTGCTGTGAAGTTCAGGGTTGTGAGCGGGAAGATGCTA  958

Query  962  TCTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAG  1035
            |.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||..|||||..|||..||||||||||||
Sbjct  959  TTTCTTACTACACTCGAATGAATGACAGCCTGCTGGAGAGGATCACAGCCGAAGAGAGCCGGGTCCAGGACCAG  1032

Query 1036  CCCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTG  1109
            |||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1033  CCCCTGGGAATGGCCTTTGTCACCTTCCGTGAGAAGTCCATGGCTACCTACATACTGAAAGACTTCAATGCCTG  1106

Query 1110  CAAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGT  1183
            ||||||.|||.||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||||||.|..||||||||
Sbjct 1107  CAAGTGCCAGGGCCTTCGGTGCAAAGGGGAGCCCCAGCCATCCTCCTATAGCAGAGAGCTCTGTGTCTCCAAGT  1180

Query 1184  GGACAGTCACCTTTG-CTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTG  1256
            ||||.|||||.|||| ||.|| |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||
Sbjct 1181  GGACGGTCACTTTTGCCTCCT-ATCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCCATCCAGGGCGTTCGCTGGTG  1253

Query 1257  GCTACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGT  1330
            |||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||..|||.|||.||||||||||||||.|||||||||||..|||
Sbjct 1254  GCTCCAGTGGCTGGGTATCAACTTCTCTCTGTTTGTGGTGCTGTTTTTCCTGACCACGCCCTCCATCATTATGT  1327

Query 1331  CCACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCC  1404
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  CTACCATGGACAAGTTCAATGTTACCAAACCCATCCACGCACTGAATAACCCCGTCATCAGCCAGTTCTTCCCC  1401

Query 1405  ACCCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTG  1478
            ||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1402  ACACTCCTGCTGTGGTCCTTCTCTGCGCTGCTTCCGTCCATTGTCTACTACTCCACGCTGCTGGAGTCCCACTG  1475

Query 1479  GACCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGC  1552
            |||.|.|||.||||||||||.|||||||.||.|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  GACAAGGTCAGGGGAAAACCGGATCATGGTGTCGAAGGTCTACATATTTTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGC  1549

Query 1553  CCTCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATC  1626
            |||||||.|||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 1550  CCTCCCTCGGTCTCACCAGCTTGGATTTCTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAAACCTCAATC  1623

Query 1627  AGGTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGG  1700
            |||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1624  AGGCTAGAGTGTGTCTTCCTGCCAGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTACGTCATCGCCTCAGCCTTCATCGG  1697

Query 1701  CAATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTG  1774
            ||.|||||||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1698  CAGTGGCATGGAGCTGTTGCGCCTGCCCGGCCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCCG  1771

Query 1775  CTGACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGT  1848
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1772  CTGACCGCAGGAATGTTAAGCAGAACCAGGCTTTTGAATACGAGTTTGGAGCCATGTATGCGTGGATGCTGTGT  1845

Query 1849  GTCTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCT  1922
            ||||||||.||||||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846  GTCTTCACCGTCATCATGGCTTACAGCATCACCTGCCCCATTATCGTGCCCTTTGGCCTCATCTACATCCTGCT  1919

Query 1923  CAAGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTG  1996
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||.|
Sbjct 1920  TAAGCACATGGTGGACCGGCATAACCTCTACTTCGCTTACCTCCCGGCTAAACTGGAGAAGAGGATCCACTTCG  1993

Query 1997  CCGCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTG  2070
            ||||.||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 1994  CCGCCGTGAACCAGGCCCTGGCCGCCCCCATCCTCTGCCTCTTCTGGCTCTTCTTTTTCTCCTTCCTCCGTCTG  2067

Query 2071  GGTATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCT-CACA  2143
            |||.|||.||||||.|||||.||.||||||||||||||..|.||||||||||||||||.|||||| ||| .|||
Sbjct 2068  GGTCTGACGGCCCCGGCCACGCTCTTCACCTTCCTGGTTGTTCTGCTCACCATCCTGGCCTGCCT-GCTGTACA  2140

Query 2144  CCTGCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGT  2217
            |||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.
Sbjct 2141  CCTGCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCATGGAACTACAAGACAGAAGAATCAGCTAGTGACAAAGGAAGC  2214

Query 2218  GAGGCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAG  2291
            ||.||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2215  GAAGCCGAGGCCCACGTGCCCCCGCCATTCACACCCTATGTGCCTCGGATTCTGAACGGTTTGGCCTCAGAGAG  2288

Query 2292  GACAGCACTG-TCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCT  2364
            ||||||   | |.|||.||    |||||||||||||||||.||||||||||..||||||||.||||||.|.|||
Sbjct 2289  GACAGC---GTTATCCCCA----CAGCAGCAGCAGACCTACGGTGCCATCCGTAACATCAGTGGGACTCTTCCT  2355

Query 2365  GGACAGTGCTTGGCGC-AGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC  2421
            ||.|||..|.||||.| |||.| |.|..||||.||.||||..||||..||||||..||
Sbjct 2356  GGGCAGCCCGTGGCTCAAGATC-CTAGTGGCACTGCGGCTTATGCCTACCAGGAATCC  2412