Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02232
• Subject: XM_006711841.4
• Aligned Length: 2421
• Identities: 1890
• Gaps: 531

Alignment

Query    1  ATGATGGACTCCCCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGGCCCAACGACTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCCCCACTGTCCTGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTCTGGGACTATGGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TTCCTCCTCAGGTCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ATGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC  74

Query  445  CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAA  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct   75  CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTG-----  143

Query  519  AGACCCGTATAGTTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCA  592
                                                                                      
Sbjct  144  --------------------------------------------------------------------------  143

Query  593  TCTTTGCTGTCATTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAG  666
                                                                                      
Sbjct  144  --------------------------------------------------------------------------  143

Query  667  GAGAACCTGGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCA  740
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  --------GGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCA  209

Query  741  CTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  CTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACC  283

Query  815  TGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  TGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGG  357

Query  889  ACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  ACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCAT  431

Query  963  CTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  CTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGC  505

Query 1037  CCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  CCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGC  579

Query 1111  AAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  AAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTG  653

Query 1185  GACAGTCACCTTTGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  GACAGTCACCTTTGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGC  727

Query 1259  TACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  TACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCC  801

Query 1333  ACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  ACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCAC  875

Query 1407  CCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGA  949

Query 1481  CCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  CCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCC  1023

Query 1555  TCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  TCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAG  1097

Query 1629  GTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  GTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCA  1171

Query 1703  ATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  ATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCT  1245

Query 1777  GACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  GACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGT  1319

Query 1851  CTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320  CTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCA  1393

Query 1925  AGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394  AGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCC  1467

Query 1999  GCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468  GCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGG  1541

Query 2073  TATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542  TATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCT  1615

Query 2147  GCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616  GCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG  1689

Query 2221  GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGAC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGAC  1763

Query 2295  AGCACTGTCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  AGCACTGTCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGAC  1837

Query 2369  AGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC  2421
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  AGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC  1890