Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02232
- Subject:
- XR_949163.3
- Aligned Length:
- 3441
- Identities:
- 2421
- Gaps:
- 1020
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGAGTTTCACTTTGTAACTTTTAAGTGGTCGGAACACGCCCCGCGCTGCTGGGTCCCGCCAGACACGCCGCCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGCAGGAAAGTCTACAGTTTGGTACCCCAGGACTCGCTGGTCAGGAAAGCCCTGCAGGACATGAGTGTTAGGCC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CGACGCCTGGCCCTTGGCAGCTTGGGAGGTGGCTGGGGCTGCTTTTGCCTTTGCCAGAGACAGCTCCAACTGAG 222
Query 1 --------------------------------------------------------------ATGATGGACTCC 12
||||||||||||
Sbjct 223 GACCTCTCCAACGGGCCCATCCACAGTCCTTCCTTCCCCTAGTGTCTGGGAAGACAGGCGCGATGATGGACTCC 296
Query 13 CCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGACCGGCCCAACGA 86
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGACCGGCCCAACGA 370
Query 87 CTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCATCCCCACTGTCC 160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCATCCCCACTGTCC 444
Query 161 TGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGATTCTGGGACTAT 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGATTCTGGGACTAT 518
Query 235 GGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGACTTCCTCCTCAGG 308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGACTTCCTCCTCAGG 592
Query 309 TCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGCATGATGACCAGA 382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGCATGATGACCAGA 666
Query 383 TCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTCCTGTTGGTGGTG 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTCCTGTTGGTGGTG 740
Query 457 GTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAAAGACCCGTATAG 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAAAGACCCGTATAG 814
Query 531 TTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCATCTTTGCTGTCA 604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCATCTTTGCTGTCA 888
Query 605 TTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAGGAGAACCTGGTG 678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAGGAGAACCTGGTG 962
Query 679 AGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCACTTCCGGGACGC 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCACTTCCGGGACGC 1036
Query 753 GTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACCTGTGCAAGGAGA 826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACCTGTGCAAGGAGA 1110
Query 827 AAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGGACCCTCATCAAC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGGACCCTCATCAAC 1184
Query 901 CCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCATCTCTTACTACAC 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCATCTCTTACTACAC 1258
Query 975 ACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGCCCCTGGGAATGG 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGCCCCTGGGAATGG 1332
Query 1049 CCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGCAAGTGTCAGAGC 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGCAAGTGTCAGAGC 1406
Query 1123 CTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTGGACAGTCACCTT 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTGGACAGTCACCTT 1480
Query 1197 TGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGCTACAGTGGCTGG 1270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGCTACAGTGGCTGG 1554
Query 1271 GCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCCACCATGGACAAG 1344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCCACCATGGACAAG 1628
Query 1345 TTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCACCCTCCTGCTCTG 1418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCACCCTCCTGCTCTG 1702
Query 1419 GTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGACCAAGTCGGGGG 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGACCAAGTCGGGGG 1776
Query 1493 AAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCCTCCCTGGGTCTC 1566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCCTCCCTGGGTCTC 1850
Query 1567 ACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAGGTTGGAGTGCGT 1640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAGGTTGGAGTGCGT 1924
Query 1641 CTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCAATGGCATGGAGC 1714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCAATGGCATGGAGC 1998
Query 1715 TGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCTGACCGCAGGAAT 1788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCTGACCGCAGGAAT 2072
Query 1789 GTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGTCTTCACTGTCAT 1862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGTCTTCACTGTCAT 2146
Query 1863 CGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCAAGCACATGGTGG 1936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCAAGCACATGGTGG 2220
Query 1937 ACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCCGCTGTGAACCAG 2010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCCGCTGTGAACCAG 2294
Query 2011 GCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGGTATGAAGGCCCC 2084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGGTATGAAGGCCCC 2368
Query 2085 CGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCTGCTTTGGATGCT 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCTGCTTTGGATGCT 2442
Query 2159 TCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAGGCAGAGGCCCAC 2232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAGGCAGAGGCCCAC 2516
Query 2233 ATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGACAGCACTGTCTCC 2306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 ATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGACAGCACTGTCTCC 2590
Query 2307 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGACAGTGCTTGGCGC 2380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGACAGTGCTTGGCGC 2664
Query 2381 AGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC--------------------------------- 2421
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCCTGAGGCTGGGTCTCACTGCTCTGAAAAGACACA 2738
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 2739 ACCAGAATGGCCTGGGGCTCAGGCCCTTGGCTGAGTGGGAATGCGTTGGGACTGCCCAGCTGAGCTATCAGGAC 2812
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 2813 TTAAACAGGCACAATCAAAACCATCTCAGTCAGAAGTCAGAGCGTGGTACCTGGGAGAGAACCCCGAGGGGCAT 2886
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 2887 CTGGAGTGTTGGGGCCATGTTGGTGATATGGACGTACTTCACTTGTGAAAATTCTCACCAAAATGTTCACAAGT 2960
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 2961 TCTTTTGAAGGAGAGGGGATGTGGGGAGGGAGAAGAGGTTATATGAGATTGTCTTTAATGTTTTGTACTTTTTG 3034
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 3035 CATTTTTAAGCTTTTTGACAACATGTATTTTATAATCAGAGAAAAATGCTGACTTTTATAAAGTGCCATTATTA 3108
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 3109 TGATTATGAGCTGCCTCGTGTGTGTGGGCATGGGTTTGCCATGAAAACTATGAAGAACTTTGAGATGGGCAAGA 3182
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 3183 CAATTCCTGGGTGTCTTCTGGACAAGATCTAGGGAGTTACCTAGCAGACCTTCCGGACTGACGTGATGCTACAG 3256
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 3257 GGGTCCCATCTTTCCTTGTCATTGAGCTATTTTACAGTTCTGTGAATTGTAAAGAACTGAGGGTAATGCGAATG 3330
Query 2422 -------------------------------------------------------------------------- 2421
Sbjct 3331 ACTCTTGTTCATAGAGGCAAATGAATTTTGTCCCATGGAGATTTAATTGATATTACTCTGTGGATGTTGACAAG 3404
Query 2422 ------------------------------------- 2421
Sbjct 3405 TTTTGTGTCTGTTAGCAAATTAATTTCAGTGTTCTTA 3441