Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02244
• Subject: NM_008959.3
• Aligned Length: 1419
• Identities: 1287
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCTGCGTGGGGAGCCGGACCCTAAGCAAGGATGATGTGAACTACAAAATGCATTTCCGGATGATCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCTGCGTGGGGAGCAGGACTCTGAGCAAGGATGATGTGAACTACAGGATGCATTTCCGCATGATCAA  74

Query   75  CGAGCAGCAAGTGGAGGACATCACCATTGACTTCTTCTACCGGCCGCATACCATCACCCTGCTCAGCTTCACCA  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAGCAGCAAGTGGAGGACATCACCATAGACTTCTTCTACCGGCCGCACACCATCACCCTGCTCAGCTTCACCA  148

Query  149  TCGTCAGCCTCATGTACTTCGCCTTTACCAGGGATGACTCTGTTCCAGAAGACAACATCTGGAGAGGCATCCTC  222
            ||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  TCATCAGCCTCATGTACTTCGCCTTCACCAGGGATGACTCTGTTCCGGAAGACAACATCTGGAGAGGCATCCTG  222

Query  223  TCTGTTATTTTCTTCTTTCTTATCATCAGTGTGTTAGCTTTCCCCAATGGTCCGTTCACTCGACCTCATCCAGC  296
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGTTATCTTCTTCTTTCTCATCATCAGCGTGTTAGCATTCCCCAATGGTCCATTTACTCGACCTCATCCAGC  296

Query  297  CTTATGGCGAATGGTTTTTGGACTCAGTGTGCTCTACTTCCTGTTCCTGGTATTCCTACTCTTCCTGAATTTCG  370
            |||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||.|||.||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  297  CTTATGGCGAATGGTTTTTGGTCTCAGTGTGTTGTATTTCCTCTTCTTGGTATTCCTCCTTTTCCTGAACTTCG  370

Query  371  AGCAGGTTAAATCTCTAATGTATTGGCTAGATCCAAATCTTCGATACGCCACAAGGGAAGCAGATGTCATGGAG  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||.||..||||||||
Sbjct  371  AGCAGGTTAAATCCCTGATGTATTGGCTGGATCCCAATCTTCGATATGCTACACGAGAAGCGGACATCATGGAG  444

Query  445  TATGCTGTGAACTGCCATGTGATCACCTGGGAGAGGATTATCAGCCACTTTGATATTTTTGCATTTGGACATTT  518
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  445  TATGCTGTGAACTGTCATGTGATAACCTGGGAGAGAATCGTTAGTCACTTTGATATATTTGCATTTGGCCATTT  518

Query  519  CTGGGGCTGGGCCATGAAGGCCTTGCTGATCCGTAGTTACGGTCTCTGCTGGACAATCAGTATTACCTGGGAGC  592
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  CTGGGGCTGGGCCATGAAGGCCTTGTTGATCCGTAGTTATGGGCTTTGCTGGACAATCAGTATCACCTGGGAGC  592

Query  593  TGACTGAGCTCTTCTTCATGCATCTCCTCCCCAATTTTGCCGAGTGCTGGTGGGATCAAGTCATTCTGGACATC  666
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGACAGAGCTTTTCTTCATGCATCTCCTGCCCAATTTTGCTGAGTGCTGGTGGGACCAAGTCATTCTGGACATC  666

Query  667  CTGTTGTGCAATGGCGGTGGCATTTGGCTGGGCATGGTCGTTTGCCGGTTTTTAGAGATGAGGACTTACCACTG  740
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CTGTTGTGCAATGGTGGTGGAATCTGGCTGGGCATGGTCGTTTGCCGGTTTCTGGAGATGAGAACTTACCACTG  740

Query  741  GGCAAGCTTCAAGGACATTCATACCACCACCGGGAAGATCAAGAGAGCTGTTCTGCAGTTCACTCCTGCTAGCT  814
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGCAAGCTTCAAGGACATCCACACCACCACAGGGAAGATCAAGCGAGCTGTGCTGCAGTTCACCCCTGCTAGCT  814

Query  815  GGACCTATGTTCGATGGTTTGACCCCAAATCTTCTTTTCAGAGAGTAGCTGGAGTGTACCTTTTCATGATCATC  888
            ||||.||.||..|.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||||||.
Sbjct  815  GGACTTACGTCAGGTGGTTTGATCCCAAGTCTTCCTTTCAGAGAGTGGCTGGTATATACCTCTTCATGATCATA  888

Query  889  TGGCAGCTGACTGAGTTGAATACCTTCTTCTTGAAGCATATCTTTGTGTTCCAAGCCAGTCATCCATTAAGTTG  962
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  889  TGGCAGTTGACTGAGTTGAATACCTTCTTCTTGAAGCACATCTTTGTGTTCCAAGCCAGCCATCCCTTAAGCTG  962

Query  963  GGGTAGAATTCTCTTTATTGGTGGCATCACAGCTCCCACAGTGAGACAGTACTACGCTTACCTCACCGACACAC  1036
            |||||||||.|||||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  GGGTAGAATCCTCTTCATCGGCTGCATTACGGCTCCCACAGTGAGACAGTACTATGCCTACCTCACGGACACAC  1036

Query 1037  AGTGCAAGCGCGTAGGAACACAATGCTGGGTGTTTGGGGTCATTGGTTTCCTGGAGGCCATTGTTTGCATAAAA  1110
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTGCAAGCGTGTAGGGACACAGTGCTGGGTGTTTGGGGTCATTGGTTTCCTGGAAGCTATTGTTTGCATAAAA  1110

Query 1111  TTTGGACAAGATCTCTTCTCTAAGACCCAAATACTCTATGTTGTGCTTTGGCTTCTTTGCGTGGCTTTCACCAC  1184
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  TTTGGACAAGATCTCTTTTCTAAGACCCAGATACTCTATGTGATGCTTTGGCTTCTTTGTGTGGCCTTCACCAC  1184

Query 1185  TTTCCTCTGTCTGTACGGCATGATTTGGTATGCAGAACACTATGGTCACCGAGAAAAGACCTACTCGGAGTGTG  1258
            .|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185  GTTCCTGTGTCTGTACGGCATGGTTTGGTATGCAGAGCACTATGGTCACCGGGAAAAGACCTATTCAGAGTGTG  1258

Query 1259  AAGATGGCACCTACAGTCCAGAGATCTCCTGGCATCACAGGAAAGGGACAAAAGGTTCTGAAGACAGCCCACCC  1332
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||..|.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  AAGATGGCACTTACAGTCCAGAGATCTCCTGGCATCATGGGAAAGGCTCCAAAGGTTCTGAAGACAGCCCACCG  1332

Query 1333  AAGCATGCAGGCAACAACGAAAGCCATTCTTCCAGGAGAAGGAATCGGCATTCCAAGTCAAAAGTCACCAATGG  1406
            ||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1333  AAGCATTCAAGCAACCACGAAAGCCATTCTTCCAGAAGAAGGAACCGGCATTCTAAGTCCAAAGTCACTAATGG  1406

Query 1407  CGTTGGAAAGAAA  1419
            .||||||||||||
Sbjct 1407  AGTTGGAAAGAAA  1419