Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02273
• Subject: NM_015365.3
• Aligned Length: 999
• Identities: 888
• Gaps: 111

Alignment

Query   1  ATGGCGGCGGGTTGCTGCGGGGTGAAGAAGCAGAAACTGTCCAGTTCGCCCCCCTCTGGCTCGGGTGGCGGTGG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGGCGGGTTGCTGCGGGGTGAAGAAGCAGAAACTGTCCAGTTCGCCCCCCTCTGGCTCGGGTGGCGGTGG  74

Query  75  TGGCGCCTCCTCCTCCTCCCACTGCAGCGGAGAGAGCCAGTGCCGAGCTGGGGAGCTGGGACTAGGAGGCGCCG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGGCGCCTCCTCCTCCTCCCACTGCAGCGGAGAGAGCCAGTGCCGAGCTGGGGAGCTGGGACTAGGAGGCGCCG  148

Query 149  GTACGCGGCTCAACGGGCTGGGAGGTCTAACCGGAGGAGGTAGCGGCAGCGGCTGTACCCTCTCTCCCCCCCAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GTACGCGGCTCAACGGGCTGGGAGGTCTAACCGGAGGAGGTAGCGGCAGCGGCTGTACCCTCTCTCCCCCCCAG  222

Query 223  GGCTGCGGCGGCGGCGGCGGGGGGATCGCCCTGTCGCCACCTCCGAGCTGCGGAGTGGGGACCCTACTTTCTAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGCTGCGGCGGCGGCGGCGGGGGGATCGCCCTGTCGCCACCTCCGAGCTGCGGAGTGGGGACCCTACTTTCTAC  296

Query 297  CCCGGCCGCCGCCACCTCTTCCTCACCCTCCTCATCGTCCGCCGCCTCGTCCTCATCGCCGGGCTCCCGGAAGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CCCGGCCGCCGCCACCTCTTCCTCACCCTCCTCATCGTCCGCCGCCTCGTCCTCATCGCCGGGCTCCCGGAAGA  370

Query 371  TGGTGGTGTCAGCAGAGATGTGCTGCTTTTGCTTCGATGTGCTCTACTGTCACCTGTATGGATACCAGCAGCCC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TGGTGGTGTCAGCAGAGATGTGCTGCTTTTGCTTCGATGTGCTCTACTGTCACCTGTATGGATACCAGCAGCCC  444

Query 445  CGGACCCCCCGATTCACCAACGAGCCCTA---------------------------------------------  473
           |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct 445  CGGACCCCCCGATTCACCAACGAGCCCTACCCACTGTTTGTAACATGGAAGATTGGTCGAGACAAAAGATTACG  518

Query 474  ------------------------------------------------------------------TGCCCTTA  481
                                                                             ||||||||
Sbjct 519  TGGATGCATAGGTACTTTTTCTGCCATGAATTTGCATTCAGGACTCAGGGAGTACACACTTACCAGTGCCCTTA  592

Query 482  AAGATAGCCGTTTTCCCCCAATGACAAGGGATGAGCTGCCACGGCTTTTCTGCTCAGTGTCTCTGCTCACTAAC  555
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AAGATAGCCGTTTTCCCCCAATGACAAGGGATGAGCTGCCACGGCTTTTCTGCTCAGTGTCTCTGCTCACTAAC  666

Query 556  TTTGAAGATGTCTGTGATTATTTGGACTGGGAGGTGGGTGTACATGGCATTAGAATAGAATTCATCAATGAAAA  629
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TTTGAAGATGTCTGTGATTATTTGGACTGGGAGGTGGGTGTACATGGCATTAGAATAGAATTCATCAATGAAAA  740

Query 630  AGGATCAAAACGCACCGCCACCTACCTACCGGAGGTTGCAAAGGAGCAAGGATGGGACCATATACAGACCATAG  703
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  AGGATCAAAACGCACCGCCACCTACCTACCGGAGGTTGCAAAGGAGCAAGGATGGGACCATATACAGACCATAG  814

Query 704  ACTCCTTATTGAGGAAAGGAGGATACAAAGCTCCGATTACTAATGAATTCAGGAAAACCATAAAACTGACCAGG  777
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  ACTCCTTATTGAGGAAAGGAGGATACAAAGCTCCGATTACTAATGAATTCAGGAAAACCATAAAACTGACCAGG  888

Query 778  TATCGTAGTGAAAAGATGACCCTGAGCTATGCTGAATACCTTGCTCATCGCCAGCATCATCATTTCCAAAATGG  851
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  TATCGTAGTGAAAAGATGACCCTGAGCTATGCTGAATACCTTGCTCATCGCCAGCATCATCATTTCCAAAATGG  962

Query 852  CATTGGGCATCCCCTTCCGCCATACAACCATTATTCC  888
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963  CATTGGGCATCCCCTTCCGCCATACAACCATTATTCC  999