Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02304
• Subject: XM_006511336.1
• Aligned Length: 1088
• Identities: 769
• Gaps: 238

Alignment

Query    1  ATGGAAGAGTTGAGTCAGGCCCTGGCTAGTAGCTTTTCTGTGTCTCAAGATCTGAACAGCACAGCTGCCCCACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCCCGCCTATCCCAGTACAAGTCCAAGTACAGTTCCTTGGAGCAGAGTGAGCGCCGCCGGAGGTTACTGGAAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCAGAAATCCAAGCGGCTGGATTATGTGAACCATGCCAGAAGACTGGCTGAAGATGACTGGACAGGGATGGAG  222
                                                                                ||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------ATGGAG  6

Query  223  AGTGAGGAA---GAAAATAAGAAAGATGATGAAGAAATGGACATTGACACTGTCAAGAAGTTACCAAAACACTA  293
            ||||.||||   |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||.||..|||||||||||||||||.|||
Sbjct    7  AGTGGGGAAGAGGAAAACAAGAAAGATGAAGAGGAAATGGACATAGACCCTAGCAAGAAGTTACCAAAACGCTA  80

Query  294  TGCTAATCAATTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGTTCCTTCAGATTTGGGGCAGGAATGGATTGTGGTCG  367
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct   81  TGCTAATCAATTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGTCCCTTCAGATTTGGGGCAAGAATGGATTGTGGTTG  154

Query  368  TGTGCCCTGTTGGAAAAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGGGGTTCTACCAGTGCCTACACCAAGAGTGGCTAC  441
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  155  TGTGTCCTGTTGGGAAAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGGGGTTCAACAAGTGCCTACACTAAGAGTGGCTAC  228

Query  442  TGTGTCAACAGGTTTTCTTCACTTCTGCCAGGAGGCAACAGGCGAAACT---CAACAGCAAAAGACTACACCAT  512
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||   |||||||.||||||||||||||
Sbjct  229  TGTGTCAATAGGTTTTCTTCCCTTCTGCCCGGAGGCAACAGGAGAAACTCAACAACAGCCAAAGACTACACCAT  302

Query  513  TCTAGATTGCATTTACAATGAGGTAAACCAGACCTACTACGTTCTGGATGTGATGTGCTGGCGGGGACACCCTT  586
            |||.|||||||||||||.||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  303  TCTGGATTGCATTTACAGTGAGGTGAATCAGACATACTATGTTTTGGATGTGATGTGCTGGCGGGGACATCCTT  376

Query  587  TTTATGATTGCCAGACTGATTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGACTGGGAGAG  660
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  377  TTTATGACTGTCAGACTGATTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGGCTTGGAGAG  450

Query  661  AAAACCAAGCTTAATCCTTTTAAATTTGTGGGGCTAAAGAACTTCCCTTGCACTCCCGAAAGCCTGTGTGATGT  734
            |||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  451  AAAACCAAGATTAATCCTTTTAAGTTTGTGGGGCTAAAGAATTTCCCGTGTACCCCTGAGAGCCTGTGTGAGGT  524

Query  735  GCTATCTATGGATTTCCCTTTTGAGGTAGATGGACTTCTCTTCTACCACAAACAGACCCACTACAGCCCCGGAA  808
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  525  GCTGTCTATGGATTTTCCTTTTGAGGTAGATGGGCTGCTCTTCTACCATAAACAGACCCACTATAGCCCTGGGA  598

Query  809  GCACTCCCTTGGTGGGCTGGCTGCGCCCCTACATGGTGTCAGATGTCCTTGGTGTAGCTGTGCCGGCTGGCCCG  882
            |.|||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  599  GTACTCCTCTGGTGGGTTGGCTGCGCCCCTACATGGTGTCAGATATTCTGGGTGTAGCTGTTCCAGCTGGCCCA  672

Query  883  CTGACCACCAAGCCAGACTATGCTGGGCACCAGCTCCAGCAGATTATGGAGCACAAGAAGAGCCAGAAGGAAGG  956
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||||   ||||||.
Sbjct  673  CTGACCACCAAGCCAGAATACGCTGGGCACCAGCTCCAACAGATTATTGAGCACAAGAGGAGCC---AGGAAGA  743

Query  957  CATGAAGGAGAAACTCACACACAAGGCCTCTGAGAATGGGCACTATGAATTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGT  1030
            ||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  CACAAAGGAGAAACTCACACACAAGGCTTCTGAGAATGGCCACTATGAGCTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGT  817

Query 1031  T--GAAGGGTTCTTCCCATAGCCCAGACCACCCTGGATGCCTCATGGAGAAT  1080
            |  |||  .|.||.||||.|||.|.||        || ||||||||||.||.
Sbjct  818  TAAGAA--ATCCTCCCCACAGCTCTGA--------GA-GCCTCATGGACAAC  858