Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02305
• Subject: NM_011821.3
• Aligned Length: 1671
• Identities: 1479
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGCCTTCTTGGATCGGGGCTGTGATTCTTCCCCTCTTGGGGCTGCTGCTCTCCCTCCCCGCCGGGGCGGATGT  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||||.||||..|||||||||||..|||||||.||||.||||||.||
Sbjct    1  ATGCCTTCTTGGATCCGGGCTGTGATTCTTCCTCTCTCCGGGCTGCTGCTGACCCTCCCGGCCGCGGCGGACGT  74

Query   75  GAAGGCTCGGAGCTGCGGAGAGGTCCGCCAGGCGTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC  148
            ||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGGCTCGGAGCTGCAGCGAGGTCCGTCAGGCTTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC  148

Query  149  AGGAGATCGCAGGGGAACACTTAAGAATCTGTCCTCAGGAATATACATGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG  222
            ||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGATCGCAGGGGAGCACTTACGCATCTGCCCTCAGGAATATACCTGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG  222

Query  223  TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT  296
            .|.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||
Sbjct  223  CTGAGTCAACAGAGTAAACTGGAGTTTGAAAACCTTGTAGAAGAGACAAGCCACTTTGTGAGGACCACGTTTGT  296

Query  297  GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT  370
            |||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  GTCGAGGCACAAGAAATTTGATGAGTTTTTCCGAGAGCTGCTGGAAAACGCAGAAAAGTCCCTAAATGACATGT  370

Query  371  TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG  444
            ||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||..||
Sbjct  371  TTGTCCGGACCTACGGGATGCTGTACATGCAGAATTCAGAGGTATTCCAGGACCTCTTCACTGAGCTAAAGCGG  444

Query  445  TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT  518
            ||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||
Sbjct  445  TACTACACAGGGGGTAACGTCAACCTGGAAGAGATGCTCAATGACTTCTGGGCTCGGCTCCTGGAGAGGATGTT  518

Query  519  TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA  592
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  519  CCAGCTGATTAACCCTCAGTATCACTTCAGCGAGGACTACCTGGAGTGTGTAAGCAAGTACACAGACCAGCTGA  592

Query  593  AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..|.|||||||||
Sbjct  593  AGCCATTTGGAGACGTGCCACGGAAACTGAAGATTCAGGTCACCCGCGCCTTCATCGCGGCTCGCACCTTTGTC  666

Query  667  CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC  740
            |||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct  667  CAGGGCCTGACAGTGGGCAGAGAGGTTGCCAACCGAGTTTCCAAGGTGAGCCCCACCCCTGGCTGCATCCGGGC  740

Query  741  CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTT-CCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTC  813
            .||||||||||||||||||||||||||||| |.|.||||| |||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  741  TCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTG-CCGAGGCTTGCCCACTGTGAGACCTTGCAACAACTACTGCCTC  813

Query  814  AACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCT  887
            ||||||||||||||||||.||||.||||||||.||..|.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  814  AACGTCATGAAGGGCTGCCTGGCCAATCAGGCAGATTTGGACACTGAGTGGAATCTCTTCATAGATGCAATGCT  887

Query  888  CTTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTG  961
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  888  CTTGGTGGCTGAGCGACTGGAAGGGCCATTCAACATTGAGTCAGTCATGGACCCAATAGACGTCAAGATCTCTG  961

Query  962  AAGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAA  1035
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  962  AAGCCATTATGAACATGCAGGAAAACAGCATGCAGGTGTCAGCAAAGGTCTTTCAGGGCTGTGGCCAGCCCAAA  1035

Query 1036  CCTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGA  1109
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||
Sbjct 1036  CCTGCTCCCGCTCTCAGATCTGCTCGCTCAGCTCCAGAAAATTTTAACACCCGTTTTCGGCCCTACAACCCTGA  1109

Query 1110  GGAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCT  1183
            |||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1110  GGAAAGACCCACAACTGCAGCGGGCACGAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAGCTGAAGCTCT  1183

Query 1184  CTAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGACGAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAG  1257
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||..|.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1184  CTAAAAAGGTCTGGTCAGCATTGCCCTACACCATCTGCAAGGACGAACGTGTGACAGCAGGAACCTCCAACGAG  1257

Query 1258  GAGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGAGATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGAT  1331
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1258  GAGGAGTGCTGGAACGGACACAGCAAAGCCAGATACCTGCCTGAGATCATGAACGATGGGCTGACCAACCAAAT  1331

Query 1332  CAACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTTTCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTG  1405
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1332  CAACAATCCTGAGGTGGAGGTGGACATCACGCGGCCAGACACTTTCATCAGACAGCAGATCATGGCTCTCCGTG  1405

Query 1406  TGATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTCAATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGT  1479
            ||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1406  TGATGACCAACAAACTGAAGAATGCGTACAATGGCAATGACGTCAACTTCCAAGACACAAGCGATGAATCCAGT  1479

Query 1480  GGCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCACGGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCC  1553
            ||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1480  GGCTCAGGCAGCGGCAGTGGTTGCATGGATGATGTGTGTCCCACGGAGTTCGAGTTTGTCACCACCGAGGCCCC  1553

Query 1554  CGCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGC-----AGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTG  1622
            .||.|||||.||.|||||.|||||.|.|||.|||||.||     ||..||     ||..||||.||.|.|||||
Sbjct 1554  GGCGGTGGACCCGGACCGCAGAGAAGAGGAATCTTCGGCCTCGAAGTTCA-----GCTCCTCCTTGATTTCCTG  1622

Query 1623  GTCTCTCACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA  1665
            ||||||...||||||.|||.||||.|||||||||||.|.||||
Sbjct 1623  GTCTCTGGTCTGCATGGTCTTGGCCCTGCAGAGACTCTACAGA  1665