Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02313
- Subject:
- NM_020445.6
- Aligned Length:
- 1261
- Identities:
- 969
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGGCGGGACGGCTGCCGGCCTGTGTGGTGGACTGTGGCACGGGGTATACAAAACTAGGATATGCTGGAAATAC 74
|||||.||....|||||..||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 1 ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC 74
Query 75 AGAACCACAGTTTATCATCCCTTCCTGTATTGCTATTAAGGAGTCAGCAAAAGTGGGTGATCAAGCTCAAAGGA 148
.||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|..|||||||||||.||.|.|||.|||||||||||||
Sbjct 75 TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA 148
Query 149 GGGTGATGAAAGGTGTTGATGACCTAGACTTCTTCATTGGTGATGAAGCAATAGAAAAACCTACATATGCAACA 222
|.|||.|||..||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 149 GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA 222
Query 223 AAGTGGCCAATCCGCCATGGTATAGTTGAAGATTGGGA-CTTAATGGAAAGGTTTATGGAGCAAGTGATCTTTA 295
||||||||.||.||.|||||.||..|||||||.||||| ||| |||||||||||.||||||||||||.|.||||
Sbjct 223 AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTT-ATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTA 295
Query 296 AATATTTAAGGGCAGAACCTGAAGACCATTATTTTCTTTTGACTGAACCTCCATTGAATACTCCAGAAAACAGG 369
|||||.|..|.||.||||||||.||||||||||||.|..||||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||.
Sbjct 296 AATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGA 369
Query 370 GAATATACTGCTGAAATAATGTTTGAGTCCTTCAATGTTCCAGGCTTGTACATTGCTGTGCAGGCTGTTCTTGC 443
||.|||..|||.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||..|.||||||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct 370 GAGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGC 443
Query 444 CTTAGCTGCATCTTGGACCTCAAGACAAGTAGGAGAACGGACGTTGACCGGTACGGTAATAGACAGTGGAGATG 517
|||.||.|||||||||||.||..|||||||.||.|||||.|||||.||.||.|..||.||.|||||.|||||||
Sbjct 444 CTTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATG 517
Query 518 GTGTCACTCATGTCATTCCTGTGGCTGAAGGGTATGTGATTGGCAGCTGTATTAAACACATTCCAATCGCAGGA 591
|.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 518 GAGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGT 591
Query 592 CGAGATATAACATATTTTATTCAGCAACTGCTGAGAGACCGAGAAGTAGGAATCCCTCCAGAACAATCCTTGGA 665
.|||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||..|.||.||.|||||||||||.||.||.||..||||
Sbjct 592 AGAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGA 665
Query 666 AACTGCTAAGGCAGTAAAGGAGCGCTATAGTTATGTCTGCCCAGATTTAGTAAAAGAATTTAACAAGTATGATA 739
.||.||.||.||..|.||||||...||..||||..|.|||||.|||.||||.||.||||||..||||||||||
Sbjct 666 GACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGAT- 738
Query 740 CAGATGGGTC----AAAATGGATTAAACAGTATACTGGAATCAATGCTATCTCAA--AGAAAGAGTTTTCTATC 807
.|||.|| .||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.| |||| ||||..|||||..|||.
Sbjct 739 ---GTGGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGA--TCAACCAGAAGAAGTTTGTTATA 807
Query 808 GATGTTGGTTATGAGAGATTTTTGGGACCTGAAATCTTTTTTCATCCAGAGTTTGCTAATCCAGACTTTACACA 881
||.||||||||.||.|||||..|||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||...|
Sbjct 808 GACGTTGGTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGA 881
Query 882 ACCTATCTCAGAAGTTGTAGATGAAGTAATTCAGAATTGTCCTATTGATGTCAGACGTCCTCTCTACAAGAATA 955
..|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||..|.||.||.||.||.||||||.
Sbjct 882 GTCCATCTCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGAATG 955
Query 956 TTGTCCTCTCTGGAGGTTCAACCATGTTCAGGGACTTTGGACGTCGCTTGCAAAGAGATTTGAAAAGAACTGTA 1029
|.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||..||||.||.||||||||.|||...||.
Sbjct 956 TCGTACTCTCAGGAGGCTCCACCATGTTCAGGGATTTCGGACGCCGACTGCAGAGGGATTTGAAGAGAGTGGTG 1029
Query 1030 GATGCCCGGCTGAAATTAAGTGAGGAATTGAGTGGTGGTAGATTGAAGCCAAAACCTATTGATGTACAAGTCAT 1103
|||||..||||||...|.||.|||||..|.||.||.||.||..|.|||||.||.|||.|.||.||.||.||..|
Sbjct 1030 GATGCTAGGCTGAGGCTCAGCGAGGAGCTCAGCGGCGGGAGGATCAAGCCGAAGCCTGTGGAGGTCCAGGTGGT 1103
Query 1104 TACACACCACATGCAGCGATATGCAGTTTGGTTTGGAGGATCAATGCTGGCTTCCACGCCTGAGTTCTACCAAG 1177
.||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||..||.|
Sbjct 1104 CACGCATCACATGCAGCGCTACGCCGTGTGGTTCGGAGGCTCCATGCTGGCCTCGACTCCCGAGTTCTTTCAGG 1177
Query 1178 TATGCCACACCAAAAAGGATTATGAAGAAATTGGACCTAGCATTTGTCGTCACAATCCAGTGTTTGGAGTCATG 1251
|.|||||||||||.|||||.||||||||....||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1178 TCTGCCACACCAAGAAGGACTATGAAGAGTACGGGCCCAGCATCTGCCGCCACAACCCCGTCTTTGGAGTCATG 1251
Query 1252 TCG 1254
||.
Sbjct 1252 TCC 1254