Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02319
• Subject: NM_001330486.1
• Aligned Length: 1251
• Identities: 1050
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGCGCCGGGCGCCAGAGCTGTACCGGGCTCCGTTCCCGTTGTACGCGCTTCAGGTCGACCCCAGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCGGCGCCGGGCGCCAGAGCTGTACCGGGCTCCGTTCCCGTTGTACGCGCTTCAGGTCGACCCCAGCAC  74

Query   75  TGGGCTGCTCATCGCTGCGGGCGGAGGAGGCGCCGCCAAGACAGGCATAAAGAATGGCGTGCACTTTCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGCTGCTCATCGCTGCGGGCGGAGGAGGCGCCGCCAAGACAGGCATAAAGAATGGCGTGCACTTTCTGCAGC  148

Query  149  TAGAGCTGATTAATGGGCGCTTGAGTGCCTCCTTGCTGCACTCCCATGACACAGAGACACGGGCCACCATGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAGCTGATTAATGGGCGCTTGAGTGCCTCCTTGCTGCACTCCCATGACACAGAGACACGGGCCACCATGAAC  222

Query  223  TTGGCACTGGCTGGTGACATCCTTGCTGCAGGGCAGGATGCCCACTGTCAGCTCCTGCGCTTCCAGGCACATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGCACTGGCTGGTGACATCCTTGCTGCAGGGCAGGATGCCCACTGTCAGCTCCTGCGCTTCCAGGCACATCA  296

Query  297  ACAGCAGGGCAACAAGGCAGAGAAGGCCGGTTCCAAGGAGCAGGGGCCTCGACAAAGGAAGGGAGCAGCCCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGCAGGGCAACAAGGCAGAGAAGGCCGGTTCCAAGGAGCAGGGGCCTCGACAAAGGAAGGGAGCAGCCCCAG  370

Query  371  CAGAGAAGAAATGTGGAGCGGAAACCCAGCACGAGGGGCTAGAACTCAGGGTAGAGAATTTGCAGGCGGTGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAGAAGAAATGTGGAGCGGAAACCCAGCACGAGGGGCTAGAACTCAGGGTAGAGAATTTGCAGGCGGTGCAG  444

Query  445  ACAGACTTTAGCTCCGATCCACTGCAGAAAGTTGTGTGCTTCAACCACGATAATACCCTGCTTGCCACTGGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACAGACTTTAGCTCCGATCCACTGCAGAAAGTTGTGTGCTTCAACCACGATAATACCCTGCTTGCCACTGGAGG  518

Query  519  AACAGATGGCTACGTCCGTGTCTGGAAGGTGCCCAGCCTGGAGAAGGTTCTGGAGTTCAAAGCCCACGAAGGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACAGATGGCTACGTCCGTGTCTGGAAGGTGCCCAGCCTGGAGAAGGTTCTGGAGTTCAAAGCCCACGAAGGGG  592

Query  593  AGATTGAAGACCTGGCTTTAGGGCCTGATGGCAAGTTGGTAACCGTGGGCCGGGACCTTAAGGCCTCTGTGTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTGAAGACCTGGCTTTAGGGCCTGATGGCAAGTTGGTAACCGTGGGCCGGGACCTTAAGGCCTCTGTGTGG  666

Query  667  CAGAAGGATCAGCTGGTGACACAGCTGCACTGGCAAGAAAATGGACCCACCTTTTCCAGCACACCTTACCGCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAAGGATCAGCTGGTGACACAGCTGCACTGGCAAGAAAATGGACCCACCTTTTCCAGCACACCTTACCGCTA  740

Query  741  CCAGGCCTGCAGGTTTGGGCAGGTTCCAGACCAGCCTGCTGGCCTGCGACTCTTCACAGTGCAAATTCCCCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGGCCTGCAGGTTTGGGCAGGTTCCAGACCAGCCTGCTGGCCTGCGACTCTTCACAGTGCAAATTCCCCACA  814

Query  815  AGCGCCTGCGCCAGCCCCCTCCCTGCTACCTCACAGCCTGGGATGGCTCCAACTTCTTGCCCCTTCGGACCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCGCCTGCGCCAGCCCCCTCCCTGCTACCTCACAGCCTGGGATGGCTCCAACTTCTTGCCCCTTCGGACCAAG  888

Query  889  TCCTGTGGCCATGAAGTCGTCTCCTGCCTCGATGTCAGTGAATCCGGCACCTTCCTAGGCCTGGGCACAGTCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCTGTGGCCATGAAGTCGTCTCCTGCCTCGATGTCAGTGAATCCGGCACCTTCCTAGGCCTGGGCACAGTCAC  962

Query  963  TGGCTCTGTTGCCATCTACATAGCTTTCTCTCTCCAGTGCCTCTACTACGTGAGGGAGGCCCATGGCATTGTGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  963  TGGCTCTGTTGCCATCTACATAGCTTTCTCTCTCCAG-------------------------------------  999

Query 1037  TGACGGATGTGGCCTTTCTACCTGAGAAGGGTCGTGGTCCAGAGCTCCTTGGGTCCCATGAAACTGCCCTGTTC  1110
                                                                                      
Sbjct 1000  --------------------------------------------------------------------------  999

Query 1111  TCTGTGGCTGTGGACAGTCGTTGCCAGCTGCATCTGTTGCCCTCACGGCGGAGTGTTCCTGTGTGGCTCCTGCT  1184
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  -------------------------------------------------GGAGTGTTCCTGTGTGGCTCCTGCT  1024

Query 1185  CCTGCTGTGTGTCGGGCTTATTATTGTGACCATCCTGCTGCTCCAGAGTGCCTTTCCAGGTTTCCTT  1251
            ||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 1025  CCTGCTGTGTGTCGGGCTTATTATTG-----------------------------------------  1050