Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02332
- Subject:
- XM_006518373.1
- Aligned Length:
- 1184
- Identities:
- 953
- Gaps:
- 130
Alignment
Query 1 ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG 74
|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||..|.||.|||||||||||||..||.|||||
Sbjct 1 ATGGCCTTGAACGTTGCCCCCGTGAGAGACACAAAGTGGCTGACGCTGGAGGTCTGCAGACAGTACCAGAGAGG 74
Query 75 AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG 148
|||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACGTGCTCACGCTCCGACGAAGAATGCAAGTTTGCTCACCCCCCCAAAAGTTGCCAGGTTGAAAATGGAAGAG 148
Query 149 TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTCAAGGGCCGCTGTTCAAGAGAGAACTGCAAATATCTTCATCCTCCGACACAC 222
Query 223 TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA 296
||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 TTAAAAACCCAGCTAGAGATTAATGGGAGGAACAATTTGATCCAGCAAAAAACTGCAGCAGCGATGCTTGCCCA 296
Query 297 GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA 370
|||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 297 GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACGCCGCTCCATCCTGTGCCCACTTTTCCTGTAGGTCCCACCATAGGGA 370
Query 371 CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT 444
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..||
Sbjct 371 CAAATGCGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACTTAGCGCCTGTCACCCCTGGAGTTGGGTTAGTCCCAACAGAGGTT 444
Query 445 CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT 518
||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTACCCACTACACCGGTCATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT 518
Query 519 TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC 592
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TCTCAGGACTGATAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACAGACTGCC 592
Query 593 GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA 666
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTTTGCACACCCGGCAGACAGCACCATGATCGACACAAACGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA 666
Query 667 AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC 740
Query 741 GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCA------------ 802
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGCACCAAGCCAACCAGGCCGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGACTCAGTCGA 814
Query 803 ------------------------------------------TGGCCTTTCCCCCTGGTGCTCTTCATCCTTTA 834
|||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 815 CTGCCAAAGCACTGAAGCGACCTCTCGAAGCAACTGTAGACCTGGCCTTCCCTCCGGGTGCTCTTCATCCCTTA 888
Query 835 CCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCCAGCGTCTTGCACTACCAGCA 908
|||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAACGGGGCCAGCACGGTCTTCAACCCCAGCGTCTTGCACTACCAGCA 962
Query 909 GGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTCAGTTTTGTGCATGACACCCG 982
||||||.|||||.||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.||.|||| |...||.||.|..|..|
Sbjct 963 GGCTCTGACCAGTGCGCAGCTGCAGCAGCACACGGCGTTCATCCCCACAG----ATAATTCTGAAATAATC--- 1029
Query 983 CTACCAGTATTGTACCCATG--ATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGC----AGCAACAACTCCTGCA 1050
|.|||.|.||.| ||| ||||..| |..||||| || ||.|||| .|
Sbjct 1030 --AACAGAAATGGA---ATGGAATGCCAA-----------------GAATCTGCATTGAG-AATAACT----AA 1076
Query 1051 ACA-----AGTGT--------CCCC---TTCGCAGCAACA-----GCCACAGCCAATCAGATAATTCTGAAA-- 1101
||| |.||| |||| |.|.|..|||.| |||||| || |||.|.
Sbjct 1077 ACATTGTTACTGTACATATTACCCCGTTTCCTCCTCAATAGAATTGCCACA---AA----------CTGCATGC 1137