Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02332
- Subject:
- XM_006518376.3
- Aligned Length:
- 1130
- Identities:
- 953
- Gaps:
- 76
Alignment
Query 1 ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG 74
|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||..|.||.|||||||||||||..||.|||||
Sbjct 1 ATGGCCTTGAACGTTGCCCCCGTGAGAGACACAAAGTGGCTGACGCTGGAGGTCTGCAGACAGTACCAGAGAGG 74
Query 75 AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG 148
|||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACGTGCTCACGCTCCGACGAAGAATGCAAGTTTGCTCACCCCCCCAAAAGTTGCCAGGTTGAAAATGGAAGAG 148
Query 149 TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTCAAGGGCCGCTGTTCAAGAGAGAACTGCAAATATCTTCATCCTCCGACACAC 222
Query 223 TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA 296
||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 TTAAAAACCCAGCTAGAGATTAATGGGAGGAACAATTTGATCCAGCAAAAAACTGCAGCAGCGATGCTTGCCCA 296
Query 297 GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA 370
|||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 297 GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACGCCGCTCCATCCTGTGCCCACTTTTCCTGTAGGTCCCACCATAGGGA 370
Query 371 CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT 444
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..||
Sbjct 371 CAAATGCGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACTTAGCGCCTGTCACCCCTGGAGTTGGGTTAGTCCCAACAGAGGTT 444
Query 445 CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT 518
||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTACCCACTACACCGGTCATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT 518
Query 519 TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC 592
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TCTCAGGACTGATAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACAGACTGCC 592
Query 593 GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA 666
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTTTGCACACCCGGCAGACAGCACCATGATCGACACAAACGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA 666
Query 667 AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC 740
Query 741 GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTTCCCC 814
||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 741 GCAGCACCAAGCCAACCAGGCCGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTCCCTC 814
Query 815 CTGGTGCTCTTCATCCTTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCC 888
|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||||.||||||
Sbjct 815 CGGGTGCTCTTCATCCCTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAACGGGGCCAGCACGGTCTTCAACCCC 888
Query 889 AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTC 962
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 889 AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTGACCAGTGCGCAGCTGCAGCAGCACACGGCGTTCATCCCCACAG---- 958
Query 963 AGTTTTGTGCATGACACCCGCTACCAGTATTGTACCCATG--ATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGC 1034
|...||.||.|..|..| |.|||.|.||.| ||| ||||..| |..|||||
Sbjct 959 ATAATTCTGAAATAATC-----AACAGAAATGGA---ATGGAATGCCAA-----------------GAATCTGC 1007
Query 1035 ----AGCAACAACTCCTGCAACA-----AGTGT--------CCCC---TTCGCAGCAACA-----GCCACAGCC 1083
|| ||.|||| .|||| |.||| |||| |.|.|..|||.| ||||||
Sbjct 1008 ATTGAG-AATAACT----AAACATTGTTACTGTACATATTACCCCGTTTCCTCCTCAATAGAATTGCCACA--- 1073
Query 1084 AATCAGATAATTCTGAAA-- 1101
|| |||.|.
Sbjct 1074 AA----------CTGCATGC 1083