Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02599
- Subject:
- NM_001081639.3
- Aligned Length:
- 1998
- Identities:
- 1288
- Gaps:
- 576
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC 74
||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC 148
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
|||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 223 CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT 296
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA 296
Query 297 CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
|||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
Query 371 AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG 444
||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct 371 AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG 444
Query 445 GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG 518
||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA 518
Query 519 TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT 592
|.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 519 TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT 592
Query 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
Query 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG 740
Query 741 TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC 814
.|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct 741 CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC 814
Query 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
Query 889 TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA 962
||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA 962
Query 963 GTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
||||..||.||||..||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
Query 1037 GTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGA 1110
||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||
Sbjct 1037 GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA 1110
Query 1111 TCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTA 1184
||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111 TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA 1184
Query 1185 CAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCT 1258
|||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1185 CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT 1258
Query 1259 CAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCAAGGCTGGAGCAGCTAACACCCT-- 1328
|||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.||.| .||||...|||| ||||
Sbjct 1259 CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGG-----------CCCTGA 1319
Query 1329 ----CAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCAC--------ACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCT----- 1385
||||||.|||| ||.||| |.|||||| ||||| |||
Sbjct 1320 GGACCAGCCCCTCAC------------CCCCACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGG----TCTGGGAA 1369
Query 1386 --CATCCG--------CATGGGCATAGCTGGCTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC--------------- 1425
||.|.| .||.||||| ||||| ||||..||.|||||
Sbjct 1370 GGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT------CTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC 1437
Query 1426 --------------------------GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT--------- 1440
||| |..|| ||| ||||
Sbjct 1438 TTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCC 1511
Query 1441 ----GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTC-------------------------------- 1467
|.|||| ||| |||||.||||| ||||.
Sbjct 1512 TGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCA 1583
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1584 GGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCC 1657
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1658 CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCT 1731
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1732 CCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC 1805
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1806 TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGG 1879
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1880 CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1953