Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02599
- Subject:
- XM_017026182.2
- Aligned Length:
- 2022
- Identities:
- 1290
- Gaps:
- 594
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC 74
||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC 148
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
|||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 223 CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT 296
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA 296
Query 297 CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
|||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
Query 371 AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG 444
||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct 371 AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG 444
Query 445 GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG 518
||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA 518
Query 519 TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT 592
|.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 519 TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT 592
Query 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
Query 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG 740
Query 741 TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC 814
.|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct 741 CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC 814
Query 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
Query 889 TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG------- 955
||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGCCCC 962
Query 956 --------------------CAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGG 1009
|||||||||||..||.||||..||.|.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 963 TCGCCCATCCTTCTTCTCTCCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGG 1036
Query 1010 CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGA 1083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1037 CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGG 1110
Query 1084 GCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCC 1157
||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1111 GCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCC 1184
Query 1158 TGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACC 1231
|||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 1185 TGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACC 1258
Query 1232 CCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TT 1303
||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.||.| .|
Sbjct 1259 CCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCT 1330
Query 1304 CCA-------AGGC----TGGAGCAGCTAACACCCTCAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCACACCCCCAGG 1366
||| |||| .|||.|||| ||||||.||| .||.|..||..|.||||||
Sbjct 1331 CCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC-----CCCTCACCCC------------CACCGGGTCGGATCCCCAG- 1386
Query 1367 ATTACACAGTGGAGAATCT-------CATCCG--------CATGGGCATAGCTGGCTTGG---------TCCTG 1416
||||| ||| ||.|.| .||.||||| ||||| ||||.
Sbjct 1387 -------AGTGG----TCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT------CTTGGTGGCCGTCATCCTA 1443
Query 1417 GTGGTCCTC-----------------------------------------GGG---ATTCT------------- 1433
.||.||||| ||| |..||
Sbjct 1444 CTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCA 1517
Query 1434 -------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTC-------- 1467
||| |||| |.|||| ||| |||||.||||| ||||.
Sbjct 1518 GAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAG 1589
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1590 GTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGG 1663
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1664 TGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCC 1737
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1738 AGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGC 1811
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1812 GGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGC 1885
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1886 ACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGC 1959
Query 1468 ------------------------ 1467
Sbjct 1960 ATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1983