Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02599
- Subject:
- XM_017026186.1
- Aligned Length:
- 2046
- Identities:
- 1290
- Gaps:
- 618
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGACCCCCATCGTCACAGTCCT 23
||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1 ATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCT 74
Query 24 GATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAAGCCCACACTCTGGG 97
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG 148
Query 98 CTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCCTGGAGACCCAGGAG 171
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||.|||||||||||||
Sbjct 149 CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG 222
Query 172 TACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCA 245
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA 296
Query 246 GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCT 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||.
Sbjct 297 GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC 370
Query 320 GGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCC 393
|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||
Sbjct 371 GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC 444
Query 394 AGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCT 467
|||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||||||...||||||||||
Sbjct 445 AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT 518
Query 468 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCA 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||||.||||||.||||
Sbjct 519 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA 592
Query 542 TCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC 615
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC 666
Query 616 CATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 689
.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 740
Query 690 GCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGAT 763
|||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||...|||||.||||||
Sbjct 741 GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT 814
Query 764 TTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 837
||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 888
Query 838 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTC 911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 889 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC 962
Query 912 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCT 985
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||..||.|.|||
Sbjct 963 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT 1036
Query 986 CGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCAC 1059
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.
Sbjct 1037 CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA 1110
Query 1060 ACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTA 1133
|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.||
Sbjct 1111 ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA 1184
Query 1134 CCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCT 1207
|||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185 CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT 1258
Query 1208 CCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC 1281
||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.||||
Sbjct 1259 CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC 1332
Query 1282 -CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCA-------AGGC----TGGAGCAGCTAACACCCTCAGCCCATCACAAA 1342
||.|.|| ||||.|.||.| .|||| |||| .|||.|||| ||||||.|||
Sbjct 1333 TCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC-----CCCTCACCCC-------- 1391
Query 1343 ACAAGACTGCCTCACACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCT-------CATCCG--------CATGGGCATA 1401
.||.|..||..|.|||||| ||||| ||| ||.|.| .||.|||||
Sbjct 1392 ----CACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGG----TCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT- 1448
Query 1402 GCTGGCTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC----------------------------------------- 1425
||||| ||||..||.|||||
Sbjct 1449 -----CTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCA 1517
Query 1426 GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG----CA 1451
||| |..|| ||| |||| |.|||| ||| ||
Sbjct 1518 GGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCA 1591
Query 1452 CAGCCAGAGAAGCCTC---------------------------------------------------------- 1467
|||.||||| ||||.
Sbjct 1592 CAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGA 1663
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1664 AGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTG 1737
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1738 ACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATT 1811
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1812 CCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCC 1885
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1886 AGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAA 1959
Query 1468 ------------------------------------------------ 1467
Sbjct 1960 GGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 2007