Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02599
- Subject:
- XM_017026189.1
- Aligned Length:
- 2049
- Identities:
- 1288
- Gaps:
- 627
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGACCCCCATCGTCACAGTCCT 23
||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1 ATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCT 74
Query 24 GATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAAGCCCACACTCTGGG 97
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG 148
Query 98 CTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCCTGGAGACCCAGGAG 171
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||.|||||||||||||
Sbjct 149 CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG 222
Query 172 TACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCA 245
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA 296
Query 246 GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCT 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||.
Sbjct 297 GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC 370
Query 320 GGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCC 393
|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||
Sbjct 371 GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC 444
Query 394 AGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCT 467
|||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||||||...||||||||||
Sbjct 445 AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT 518
Query 468 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCA 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||||.||||||.||||
Sbjct 519 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA 592
Query 542 TCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC 615
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC 666
Query 616 CATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 689
.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 740
Query 690 GCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGAT 763
|||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||...|||||.||||||
Sbjct 741 GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT 814
Query 764 TTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 837
||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 888
Query 838 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTC 911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 889 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC 962
Query 912 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCT 985
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||..||.|.|||
Sbjct 963 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT 1036
Query 986 CGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCAC 1059
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.
Sbjct 1037 CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA 1110
Query 1060 ACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTA 1133
|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.||
Sbjct 1111 ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA 1184
Query 1134 CCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCT 1207
|||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185 CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT 1258
Query 1208 CCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC 1281
||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.||||
Sbjct 1259 CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC 1332
Query 1282 -CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCAAGGCTGGAGCAGCTAACACCCT------CAGCCCATCACAAAACAAG 1347
||.|.|| ||||.|.||.| .||||...|||| |||| ||||||.||||
Sbjct 1333 TCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGG-----------CCCTGAGGACCAGCCCCTCAC-------- 1385
Query 1348 ACTGCCTCAC--------ACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCT-------CATCCG--------CATGGGC 1398
||.||| |.|||||| ||||| ||| ||.|.| .||.|||
Sbjct 1386 ----CCCCACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGG----TCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGC 1443
Query 1399 ATAGCTGGCTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC-------------------------------------- 1425
|| ||||| ||||..||.|||||
Sbjct 1444 AT------CTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACG 1511
Query 1426 ---GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG--- 1449
||| |..|| ||| |||| |.|||| |||
Sbjct 1512 TCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGC 1585
Query 1450 -CACAGCCAGAGAAGCCTC------------------------------------------------------- 1467
|||||.||||| ||||.
Sbjct 1586 CCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCG 1657
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1658 TGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCA 1731
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1732 GTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGA 1805
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1806 ATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCC 1879
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1880 CCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAG 1953
Query 1468 --------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1954 GAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 2004