Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02599
• Subject: XM_017026190.1
• Aligned Length: 2046
• Identities: 1288
• Gaps: 624

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGACCCCCATCGTCACAGTCCT  23
                                                               ||||||||||||.||||.|||||
Sbjct    1  ATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCT  74

Query   24  GATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAAGCCCACACTCTGGG  97
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG  148

Query   98  CTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCCTGGAGACCCAGGAG  171
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||.|||||||||||||
Sbjct  149  CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG  222

Query  172  TACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCA  245
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA  296

Query  246  GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCT  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||.
Sbjct  297  GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC  370

Query  320  GGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCC  393
            |.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||
Sbjct  371  GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC  444

Query  394  AGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCT  467
            |||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||||||...||||||||||
Sbjct  445  AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT  518

Query  468  GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCA  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||||.||||||.||||
Sbjct  519  GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA  592

Query  542  TCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC  615
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC  666

Query  616  CATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT  689
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT  740

Query  690  GCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGAT  763
            |||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||...|||||.||||||
Sbjct  741  GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT  814

Query  764  TTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG  837
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG  888

Query  838  GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTC  911
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct  889  GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC  962

Query  912  CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCT  985
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||..||.|.|||
Sbjct  963  CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT  1036

Query  986  CGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCAC  1059
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.
Sbjct 1037  CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA  1110

Query 1060  ACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTA  1133
            |||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.||
Sbjct 1111  ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA  1184

Query 1134  CCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCT  1207
            |||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185  CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT  1258

Query 1208  CCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC  1281
            ||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.||||
Sbjct 1259  CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC  1332

Query 1282  -CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCAAGGCTGGAGCAGCTAACACCCT------CAGCCCATCACAAAACAAG  1347
             ||.|.||  ||||.|.||.| .||||...||||           ||||      ||||||.||||        
Sbjct 1333  TCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGG-----------CCCTGAGGACCAGCCCCTCAC--------  1385

Query 1348  ACTGCCTCAC--------ACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCT-------CATCCG--------CATGGGC  1398
                ||.|||        |.||||||        |||||    |||       ||.|.|        .||.|||
Sbjct 1386  ----CCCCACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGG----TCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGC  1443

Query 1399  ATAGCTGGCTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC--------------------------------------  1425
            ||      |||||         ||||..||.|||||                                      
Sbjct 1444  AT------CTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACG  1511

Query 1426  ---GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG---  1449
               |||   |..||                    ||| ||||             |.||||       |||   
Sbjct 1512  TCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGC  1585

Query 1450  -CACAGCCAGAGAAGCCTC-------------------------------------------------------  1467
             |||||.|||||  ||||.                                                       
Sbjct 1586  CCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCG  1657

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1658  TGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTG  1731

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1732  ACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATT  1805

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1806  CCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCC  1879

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1880  AGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAA  1953

Query 1468  ------------------------------------------------  1467
                                                            
Sbjct 1954  GGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  2001