Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02663
• Subject: NM_001257174.2
• Aligned Length: 1437
• Identities: 1110
• Gaps: 327

Alignment

Query    1  ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTGAGTCGTTGAGCAACTTGCATCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGC  370
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------ATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGC  43

Query  371  CACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  CACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTC  117

Query  445  GTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  GTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGA  191

Query  519  GCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  GCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG  265

Query  593  TTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  TTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTG  339

Query  667  GACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  GACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCAT  413

Query  741  GATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  GATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGC  487

Query  815  TTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  TTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAA  561

Query  889  CTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  CTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTT  635

Query  963  CCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  CCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAG  709

Query 1037  CTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAA  783

Query 1111  CAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  CAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG  857

Query 1185  CGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  CGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACA  931

Query 1259  ATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  ATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGAC  1005

Query 1333  AGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  AGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGA  1079

Query 1407  TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1437
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1110