Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02663
• Subject: NM_001363938.1
• Aligned Length: 1467
• Identities: 1415
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGCCACTGACTCATGGGC--CCTGGCGGTGGACGAGCAGGA-----AGCTGCGGC-----------------  50
            ||||   |||      ||||  ||.||||     ||..||.||     ..|||||||                 
Sbjct    1  ATGG---CTG------GGGCTGCCGGGCG-----CGTCCAAGATCGCGCCCTGCGGCGGTTTCCCATCACCCTG  60

Query   51  ----TGAGTCG--TTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCA  118
                || |.||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   61  CCTGTG-GGCGACTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCA  133

Query  119  AGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAG  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  134  AGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAG  207

Query  193  CTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTA  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  208  CTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTA  281

Query  267  CTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATC  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  282  CTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATC  355

Query  341  GTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCT  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  356  GTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCT  429

Query  415  CAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  CAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCC  503

Query  489  CCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAAT  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  CCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAAT  577

Query  563  TTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAG  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  TTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAG  651

Query  637  ATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAA  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  ATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAA  725

Query  711  GGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGA  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  GGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGA  799

Query  785  GGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  GGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAG  873

Query  859  AAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTA  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  874  AAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTA  947

Query  933  TGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAG  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948  TGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAG  1021

Query 1007  CCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTG  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  CCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTG  1095

Query 1081  GCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAA  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096  GCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAA  1169

Query 1155  GGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATC  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  GGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATC  1243

Query 1229  TTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGC  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244  TTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGC  1317

Query 1303  AAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTT  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318  AAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTT  1391

Query 1377  TAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1437
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392  TAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1452