Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02663
• Subject: XM_006530650.3
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1040
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTGAGTCGTTGAGCAACTTGCATCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAA---GTCTTTTGAAGAGCTTCG  293
                                                   .||   ||.| |||   ||||    ||    ||.|
Sbjct    1  ---------------------------------------ATG---TCAG-GAACATGTCT----AA----TTAG  23

Query  294  GCTGAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCAT  367
               ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||..
Sbjct   24  ---GAAACCTCAGCTTCTCCAAGGAGTCTACGCCATGGGCTTCAATCGACCGTCCAAGATCCAGGAGAATGCTC  94

Query  368  TGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCC  441
            ||||..|||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct   95  TGCCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAACCTGATTGCACAGTCCCAGTCTGGTACTGGGAAAACAGCTGCC  168

Query  442  TTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTA  515
            ||.||.||.||.|||||.|||..|||.|||||.|||.|||.|||.||.||||||.|.||.||.||||||||.||
Sbjct  169  TTTGTCCTAGCTATGCTCAGCAGAGTGGAACCAGCAGACAGATATCCTCAGTGTTTGTGCCTGTCCCCAACATA  242

Query  516  TGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATG  589
            ||||||.||..|.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct  243  TGAGCTGGCATTACAAACTGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTCACCCAGAATTGAAGCTAGCTTATG  316

Query  590  CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTG  663
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  317  CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAGAGAGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTC  390

Query  664  CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT  737
            .|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  391  TTGGACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGT  464

Query  738  CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC  811
            .||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  465  GATGATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGC  538

Query  812  TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATC  885
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.|||
Sbjct  539  TGCTTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATC  612

Query  886  AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA  959
            ||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.|||||
Sbjct  613  AAGCTAAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAA  686

Query  960  GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA  1033
            ||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  687  GTTCCAGGCCCTGTGCAACCTGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAA  760

Query 1034  CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG  1107
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  761  CAGCTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTG  834

Query 1108  GAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC  1181
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  GAGCAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGC  908

Query 1182  CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG  1255
            |||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  909  CCGTGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGATGGGAACCCAG  982

Query 1256  ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG  1329
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  983  ACAATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTGAACATGGTG  1056

Query 1330  GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC  1403
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1057  GACAGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGACTGGACAC  1130

Query 1404  AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1437
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1131  AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATCGCCAAC  1164