Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02688
Subject:
NM_001164392.1
Aligned Length:
1608
Identities:
1608
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC  74

Query   75  AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC  148

Query  149  AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG  222

Query  223  AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG  296

Query  297  AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA  370

Query  371  AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA  444

Query  445  TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA  518

Query  519  AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA  592

Query  593  ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT  666

Query  667  AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT  740

Query  741  TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC  814

Query  815  TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT  888

Query  889  AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT  962

Query  963  GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAG  1036

Query 1037  GTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCCACTTTTGGATAAGGAATCAATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCCACTTTTGGATAAGGAATCAATT  1110

Query 1111  TCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGAACTGCACATTCATCCAATACCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGAACTGCACATTCATCCAATACCTC  1184

Query 1185  AGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAGCATTTCCAGGCATTATGGATTAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAGCATTTCCAGGCATTATGGATTAT  1258

Query 1259  CTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGT  1332

Query 1333  CGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCA  1406

Query 1407  GTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTTACAACTCAATCATCTAAAGAACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTTACAACTCAATCATCTAAAGAACT  1480

Query 1481  CCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAATACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAATACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTG  1554

Query 1555  ACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCATCC  1608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCATCC  1608