Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02688
• Subject: NM_013827.3
• Aligned Length: 1779
• Identities: 1532
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC  74
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGAGAGACTCTACAGGAGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCTC  74

Query   75  AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC  148
            |.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCATCCTTGAACAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC  148

Query  149  AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG  222
            |.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGATGTCTTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGAACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG  222

Query  223  AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTGCTTCATCATATTTGAGGACAGTTCCAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATCCAAACAGGAGCCACTGG  296

Query  297  AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  GAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGATA  370

Query  371  AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA  444
            |||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGTGTGGTCAAGGATATCATCAGCTGTGTCACACACCTCATATTGACTCGAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAG  444

Query  445  TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA  518
            |||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGCTTTGTCGACAGTGCGTTTTTGCAACAACTACAAAGAGGGGTGGTGCGCTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA  518

Query  519  AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCTGACCTTGAATGGGATGCAGGCCATAAAACCA  592

Query  593  ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT  666
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTCCAGCAGTGCTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTAAAGATGCTGCAGTGCTGCAAATGT  666

Query  667  AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT  740
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  667  AAGCAGTGGTTTCATGAAGCTTGTGTCCAATGCCTTCAGAAGCCAATGCTGTTTGGAGATAGGTTTTATACATT  740

Query  741  TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC  814
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATTTGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCGTTACAGTGGGTAGATATAGCACACC  814

Query  815  TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCACAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT  888

Query  889  AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCCAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT  962

Query  963  GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT-----------------------------------------------  989
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  963  GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGTTTATGTCTGGGAAAGAAATAAAGAAGAAGAAGCATTTGTTTGGGT  1036

Query  990  --------------------------------------------------------------------------  989
                                                                                      
Sbjct 1037  TGCGAATTCGTGTTCCTCCTGTGCCACCAAATGTGGCTTTCAAAGCAGAGAAAGAACCAGAAGGAACATCCCAT  1110

Query  990  --------------------------------------------------GGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAA  1013
                                                              |||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GAATTTAAAATTAAAGGCAGAAAGGCATCCAAACCTACATCTGACTCAAGGGAAGTAAGCAATGGGATAGAAAA  1184

Query 1014  AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCTCCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC  1258

Query 1088  CACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA  1161
            .||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TACCTTTGGATAAGGAATCAGTTTCAGAGAATCCTACGTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA  1332

Query 1162  ACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAG  1235
            |.||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1333  ATTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGACCTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAACGAAACTACCTCGGCTAG  1406

Query 1236  CATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATAC  1309
            ||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATTTCCAGGCATTGTGGATTATCAGACTCTAGAAAAAGAACTCGCACAGGAAGATCATGGCCTGCTGCAATAC  1480

Query 1310  CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGAT  1383
            |||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1481  CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGCCTTCCACGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAGTTGTGAAAGAT  1554

Query 1384  GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT  1457
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGAAGAACTTAACACAGAAATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT  1628

Query 1458  ACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT  1531
            .||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAGCTCAATCACCTGAAAAACTCCATCACTAGTTATTTTGGTGCCGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT  1702

Query 1532  ACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCA  1605
            ||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  ACAGAGTTTTGGCTCGTCGGGTGACGCTTGATGGGAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCGACTGCA  1776

Query 1606  TCC  1608
            |||
Sbjct 1777  TCC  1779