Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02688
- Subject:
- XR_389261.4
- Aligned Length:
- 2381
- Identities:
- 1531
- Gaps:
- 773
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TCTGGAGAGCTGCCATTCGGCCCCGGAGTAGCTCCGCGCTCCCAGAATGCACCGCTAGTCCGCGGGAAACCAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ATGGCGAAGGGCTGTTGCGAAGTGGTCTGTGTTTGAGGCCGGTGTGAGCACGCACATTCTCCTTCCTAACCCTC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTCCCCAAGGAACTCGGTGTGTGTGTGCGTGTGCGCAGGGCTCCCGCTGGGGCGGGTGCCCAGGGAGTGCCCGG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACTCGCGGGGGAGCGCCCACGGGAACGAGATTGCTTCTATTTTCCTGTATGAAGCGGTTGGCACCACTTAAGTG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 ACCGAATGAGAAAGGTTTAACTGAGGAGGGAAGACCCACCCTGACTATGTGAGGCCACCATACCCATGGGCTGG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GGTCCTGGATTGAATCAAATGGAGGAAGCAAGCTGAGCATGAACATTGACCTTCCTGACTGCAGATATCAGTGC 444
Query 1 -----------------------------------------ATGA------------------GAGACTCTACA 15
|||| .||||||||||
Sbjct 445 GATAGCTGTCTCCTGCTTCTTCTACTATGCCTCCCCCTTCCATGATGGACTGTACTCTGAAACTAGACTCTACA 518
Query 16 GGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCCAACATCCTTGACCAA 89
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||
Sbjct 519 GGAGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCTCAGCATCCTTGAACAA 592
Query 90 GCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAGGATGTCCTAGCTA 163
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 593 GCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAAGATGTCTTAGCTA 666
Query 164 GATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATA 237
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGAACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATA 740
Query 238 TTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGGAAGTGGGGAAATGGT 311
|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 741 TTTGAGGACAGTTCCAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATCCAAACAGGAGCCACTGGGAGTGGGGAAATGGT 814
Query 312 CTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACAAGTGTGGCCAAGGAT 385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 815 CTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGATAAGTGTGGTCAAGGAT 888
Query 386 ATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAATGGCTCTGTCGGCAG 459
||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 889 ATCATCAGCTGTGTCACACACCTCATATTGACTCGAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAGTGGCTTTGTCGACAG 962
Query 460 TGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCAT 533
||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCGTTTTTGCAACAACTACAAAGAGGGGTGGTGCGCTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCAT 1036
Query 534 GAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGTT 607
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1037 GAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCTGACCTTGAATGGGATGCAGGCCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGCT 1110
Query 608 ACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCAT 681
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTAAAGATGCTGCAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCAT 1184
Query 682 GAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTTTATATGCTCTGTCTG 755
||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1185 GAAGCTTGTGTCCAATGCCTTCAGAAGCCAATGCTGTTTGGAGATAGGTTTTATACATTTATTTGCTCTGTCTG 1258
Query 756 CAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACC 829
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCGTTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACC 1332
Query 830 TAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGAT 903
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TAAGTGTTATTCACAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGAT 1406
Query 904 AGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGA 977
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCCAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGA 1480
Query 978 TTACAAGACCAT-------------------------------------------------------------- 989
||||||||||||
Sbjct 1481 TTACAAGACCATGTTTATGTCTGGGAAAGAAATAAAGAAGAAGAAGCATTTGTTTGGGTTGCGAATTCGTGTTC 1554
Query 990 -------------------------------------------------------------------------- 989
Sbjct 1555 CTCCTGTGCCACCAAATGTGGCTTTCAAAGCAGAGAAAGAACCAGAAGGAACATCCCATGAATTTAAAATTAAA 1628
Query 990 -----------------------------------GGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAA 1028
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGCAGAAAGGCATCCAAACCTACATCTGACTCAAGGGAAGTAAGCAATGGGATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAA 1702
Query 1029 ATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCCACTTTTGGATAAGG 1102
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1703 ATCTGTAGGTCGTCCTCCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCTACCTTTGGATAAGG 1776
Query 1103 AATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAG----------------------------- 1147
|||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AATCAGTTTCAGAGAATCCTACGTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGTTGTTATACCATTTAAATTCTTTTGTCT 1850
Query 1148 --GGAGAACTGAGGGAACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAG 1219
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1851 CAGGAGAACTGAGGGAATTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGACCTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAACG 1924
Query 1220 AAACTACCTCGTCTAGCATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCT 1293
|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1925 AAACTACCTCGGCTAGCATTTCCAGGCATTGTGGATTATCAGACTCTAGAAAAAGAACTCGCACAGGAAGATCA 1998
Query 1294 TGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTC 1367
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGCCTTCCACGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTC 2072
Query 1368 AGAAATTGTAAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACT 1441
||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2073 AGAAGTTGTGAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGAAGAACTTAACACAGAAATTCTGAATAACT 2146
Query 1442 TAGCAGATCAGGAGTTACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATA 1515
||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2147 TAGCAGATCAGGAGTTGCAGCTCAATCACCTGAAAAACTCCATCACTAGTTATTTTGGTGCCGCAGGTAGAATA 2220
Query 1516 GCATGTGGCGAAAAATACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATG 1589
||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCATGTGGCGAAAAATACAGAGTTTTGGCTCGTCGGGTGACGCTTGATGGGAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATG 2294
Query 1590 GGAAGGAGCAACTGCATCC------------------------------------------------------- 1608
|||||||||.|||||||||
Sbjct 2295 GGAAGGAGCGACTGCATCCTGACTGTAGGACTGAACGTAATGTTCACTGCACTCGTTTTCTGTTGGTACAGTTA 2368
Query 1609 ------------- 1608
Sbjct 2369 AAAAAAAAAAAAA 2381
