Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02717
• Subject: NM_001271428.2
• Aligned Length: 2979
• Identities: 2976
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTACGCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTACGCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGAAGA  74

Query   75  CCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCCCTG  148

Query  149  GATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATCTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATCTTG  222

Query  223  TGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGATCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGATCAC  296

Query  297  TGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCCTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCCTGG  370

Query  371  ACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAGAAG  444

Query  445  ACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAGCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAGCAT  518

Query  519  CCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATGTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATGTGA  592

Query  593  ACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAGCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAGCAC  666

Query  667  CTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCAAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCAAAC  740

Query  741  TTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTGGAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTGGAT  814

Query  815  TCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTGTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTGTCC  888

Query  889  CCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGCCCT  962

Query  963  AGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAAGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAAGTA  1036

Query 1037  GCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTCAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTCAAT  1110

Query 1111  CAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAGCCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAGCCT  1184

Query 1185  GGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCTACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCTACC  1258

Query 1259  GGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGGAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTG---GGGAAGGTGGTGCTGTGGAGC  1329

Query 1333  CGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  CGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGAGCT  1403

Query 1407  GGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGCAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGTCTCAGCTTATCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  GGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGCAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGTCTCAGCTTATCC  1477

Query 1481  TGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGTCAGATTAAGAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  TGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGTCAGATTAAGAAT  1551

Query 1555  GAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGTAACAGCCTCAGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  GAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGTAACAGCCTCAGG  1625

Query 1629  CAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATGTCAAGCCAGACT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  CAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATGTCAAGCCAGACT  1699

Query 1703  CCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACCCTGCTGGTGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  CCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACCCTGCTGGTGAAG  1773

Query 1777  GACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCAGGTAGCTCCCCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  GACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCAGGTAGCTCCCCC  1847

Query 1851  AGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCAAGGTGTTGCTGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  AGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCAAGGTGTTGCTGT  1921

Query 1925  TGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTACATGAGCTTGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  TGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTACATGAGCTTGCC  1995

Query 1999  CCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCGAAAGGATCTCAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCGAAAGGATCTCAC  2069

Query 2073  CACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGGGGAAACGCAGCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  CACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGGGGAAACGCAGCA  2143

Query 2147  GTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTGAACCCCAACCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  GTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTGAACCCCAACCTG  2217

Query 2221  CTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCATTGATGGCGT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  CTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCATTGATGGCGT  2291

Query 2295  CACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGCATTCAGAGAACT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  CACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGCATTCAGAGAACT  2365

Query 2369  GGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTCTATGAGGGCACT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  GGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTCTATGAGGGCACT  2439

Query 2443  GAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCAGTCCTATAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  GAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCAGTCCTATAT  2513

Query 2517  CTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGACACCTGCTGATTG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  CTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGACACCTGCTGATTG  2587

Query 2591  GACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAGATCCCAACAGAA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588  GACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAGATCCCAACAGAA  2661

Query 2665  CAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATTCATCAACTATAA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662  CAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATTCATCAACTATAA  2735

Query 2739  CCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTTTGGTTGTGGCCT  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736  CCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTTTGGTTGTGGCCT  2809

Query 2813  ATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGATGACTATGACTAC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810  ATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGATGACTATGACTAC  2883

Query 2887  GTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGCACAGGTGAAGCT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884  GTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGCACAGGTGAAGCT  2957

Query 2961  CCTGAATCGGGCCTGGCGA  2979
            |||||||||||||||||||
Sbjct 2958  CCTGAATCGGGCCTGGCGA  2976