Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02724
• Subject: XM_017318581.1
• Aligned Length: 1287
• Identities: 1144
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGGCCGATATAGCTCGCCAGGTGGGCGAAGATTGTCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  74

Query   75  TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG  148
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCAGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGGG  148

Query  149  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACGCTCATGGATACCCTGTTTAACACCAAGTTTGAAGGGGAGCCAGCGACCCAC  222

Query  223  ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT  296
            ||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||.||
Sbjct  223  ACACAGCCAGGGGTTCAGCTCCAGTCCAATACCTACGACCTCCAGGAGAGCAACGTGGGGTTGAAACTCACAAT  296

Query  297  CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG  370
            .||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TGTGAGCACTGTAGGCTTTGGGGATCAGATCAACAAGGAGGACAGCTACAAGCCCATCGTGGAATTCATTGATG  370

Query  371  CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC  444
            |.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCAGTTTGAGGCCTACCTACAAGAGGAGCTGAAGATCCGAAGAGTACTGCACTCCTACCATGACTCCCGAATC  444

Query  445  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCGACAGGACATTCGCTTAAGTCTCTGGACCTAGTGACCATGAAGAAGCT  518

Query  519  GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA  592
            |||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct  519  GGATAGTAAGGTGAACATCATTCCCGTTATTGCCAAGTCAGATGCCATTTCTAAGAGTGAGCTGGCAAAGTTCA  592

Query  593  AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG  666
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||   
Sbjct  593  AGATCAAAATCACCAGCGAACTTGTGAGCAATGGAGTCCAGATCTATCAGTTCCCCACAGACGATGAGTCG---  663

Query  667  GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGG  740
                                    ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  664  ------------------------GCCCACCTGCCGTTTGCTGTTGTTGGCAGCACAGAAGAAGTGAAGATAGG  713

Query  741  CAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTTG  814
            |||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  714  CAACAAGATGATGCGGGCTCGGCAGTATCCTTGGGGGACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCTCACTGCGACTTTG  787

Query  815  TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct  788  TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACGCCCGGCACTATGAA  861

Query  889  CTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTACA  962
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  862  TTGTACCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCATTCAGTTTGCA  935

Query  963  GGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGT  1036
            |||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  936  GGAGACATATGAGGCAAAGAGAAATGAGTTCCTTGGGGAGCTCCAGAAGAAAGAAGAGGAGATGAGGCAGATGT  1009

Query 1037  TCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCGT  1110
            |.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1010  TTGTCCAGAGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAGGAGGCTGAAAAAGAGCTGCATGAGAAATTTGACCGT  1083

Query 1111  CTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATGC  1184
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||||.||
Sbjct 1084  CTGAAGAAACTGCACCAGGAAGAGAAGAAGAAGCTGGAGGATAAGAAGAAATGTCTGGATGAGGAAATGAACGC  1157

Query 1185  TTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGA  1258
            .||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1158  CTTCAAGCAGAGAAAGGCGGCAGCTGAGCTGCTCCAGTCTCAGGGCTCTCAGGCTGGGGGCTCACAGACTCTGA  1231

Query 1259  AGAGAGACAAAGAGAAGAAAAACTTTTTT  1287
            |.||.||||||||||||||.||.      
Sbjct 1232  AAAGGGACAAAGAGAAGAAGAAT------  1254