Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02742
• Subject: NM_001370230.1
• Aligned Length: 1068
• Identities: 825
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGATGGAAGACAATAAGCAGCTCGCGCTCCGCATCGATGGGGCGGTCCAGTCGGCCAGCCAGGAGGAAGTTCA  74

Query    1  -------------ATGAAGGAGATGTTGGCGAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCC  61
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTTCTCCGGCAGATGAAGGAGATGTTGGCGAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCC  148

Query   62  TCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGGCCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAG  135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGGCCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAG  222

Query  136  GCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAGGGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGC  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAGGGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGC  296

Query  210  CACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCGAGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGG  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCGAGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGG  370

Query  284  ATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGGACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAG  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGGACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAG  444

Query  358  GAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGCTCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGC  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGCTCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGC  518

Query  432  CGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGCTACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGC  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGCTACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGC  592

Query  506  CGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGGAGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGG  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGGAGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGG  666

Query  580  CAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACACCCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTG  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACACCCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTG  740

Query  654  CCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGACGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACA  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGACGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACA  814

Query  728  TCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCCTCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCAC  801
            |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCCTCT-----GGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCAC  883

Query  802  AACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTTGAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGG  875
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  884  AACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCT---------------------------------------------  912

Query  876  CTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAAGCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCC  949
                                                                                      
Sbjct  913  --------------------------------------------------------------------------  912

Query  950  CTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACTGG  981
                                            
Sbjct  913  --------------------------------  912