Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02752
- Subject:
- NM_001351055.2
- Aligned Length:
- 2295
- Identities:
- 2232
- Gaps:
- 63
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGGCCAGTGAAGGCACCAACAT 23
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Sbjct 1 ATGCAGCGTGCAGGGTCAAAGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTCTAGGATGGCCAGTGAAGGCACCAACAT 74
Query 24 CCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGAATC 97
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Sbjct 75 CCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGAATC 148
Query 98 CCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCTGCCCACAGTTTAACC 171
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Sbjct 149 CCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCTGCCCACAGTTTAACC 222
Query 172 CTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTTCTT 245
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Sbjct 223 CTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTTCTT 296
Query 246 CATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGACAG 319
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Sbjct 297 CATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGACAG 370
Query 320 TCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATGGAATTTTACTGCCAG 393
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Sbjct 371 TCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATGGAATTTTACTGCCAG 444
Query 394 TCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCACAGTTCCACTCAAGGA 467
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Sbjct 445 TCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCACAGTTCCACTCAAGGA 518
Query 468 TGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAGATT 541
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Sbjct 519 TGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAGATT 592
Query 542 CTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATCGTGGATGACATTCAT 615
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Sbjct 593 CTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATCGTGGATGACATTCAT 666
Query 616 TCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAACTA 689
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Sbjct 667 TCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAACTA 740
Query 690 TGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCA 763
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Sbjct 741 TGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCA 814
Query 764 GCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAG 837
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Sbjct 815 GCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAG 888
Query 838 AAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCTGGATTTCATCGTGGA 911
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Sbjct 889 AAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCTGGATTTCATCGTGGA 962
Query 912 AACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGACAG 985
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Sbjct 963 AACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGACAG 1036
Query 986 TGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATCACCACCAAGGACAAA 1059
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Sbjct 1037 TGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATCACCACCAAGGACAAA 1110
Query 1060 GACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGA 1133
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Sbjct 1111 GACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGA 1184
Query 1134 CGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTACCC 1207
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Sbjct 1185 CGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTACCC 1258
Query 1208 TGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATCCGATCCGCTGATGTG 1281
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Sbjct 1259 TGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATCCGATCCGCTGATGTG 1332
Query 1282 TCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAA 1355
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Sbjct 1333 TCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAA 1406
Query 1356 AAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATTTGATCTTTCGAGTGG 1429
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Sbjct 1407 AAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATTTGATCTTTCGAGTGG 1480
Query 1430 GTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACAAATGGAAAGATATTA 1503
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Sbjct 1481 GTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACAAATGGAAAGATATTA 1554
Query 1504 ATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCATACG 1577
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Sbjct 1555 ATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCATACG 1628
Query 1578 GGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGGACATAATCATTGCCG 1651
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Sbjct 1629 GGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGGACATAATCATTGCCG 1702
Query 1652 ATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAGCTG 1725
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Sbjct 1703 ATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAGCTG 1776
Query 1726 ATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGTGTT 1799
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Sbjct 1777 ATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGTGTT 1850
Query 1800 TATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAGGCAGTTTGCA---- 1869
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Sbjct 1851 TATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTA 1924
Query 1870 --------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGATTTCCATAATCATTCT 1935
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Sbjct 1925 CACTCGATGGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGATTTCCATAATCATTCT 1998
Query 1936 GTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAA 2009
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Sbjct 1999 GTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAA 2072
Query 2010 TGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAAACAGCAGGATCCAGG 2083
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Sbjct 2073 TGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAAACAGCAGGATCCAGG 2146
Query 2084 TTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTATGGCCCCCAAGGCCTG 2157
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Sbjct 2147 TTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTATGGCCCCCAAGGCCTG 2220
Query 2158 GCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGTCTATCGATACTTACA 2231
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Sbjct 2221 GCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGTCTATCGATACTTACA 2294
Query 2232 G 2232
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Sbjct 2295 G 2295