Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02752
- Subject:
- XM_006714158.1
- Aligned Length:
- 2322
- Identities:
- 2232
- Gaps:
- 90
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCACAGGAGTGGCCGTTATGGAACGCAGCAGCGTGCAGGGTCAAAGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTC 74
Query 1 ----ATGGCCAGTGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCA 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAGGATGGCCAGTGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCA 148
Query 71 GTATATGCCTGGAACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAG 144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTATATGCCTGGAACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAG 222
Query 145 AACTACATTCCTGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGG 218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACTACATTCCTGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGG 296
Query 219 GGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACG 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACG 370
Query 293 CTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGAT 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGAT 444
Query 367 GGGAATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGC 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGAATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGC 518
Query 441 AGAGCACCCCACAGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTG 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAGCACCCCACAGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTG 592
Query 515 TCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAA 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAA 666
Query 589 AAGGCCAGCATCGTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGT 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGCCAGCATCGTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGT 740
Query 663 GCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCC 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCC 814
Query 737 AGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTC 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTC 888
Query 811 CTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGA 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGA 962
Query 885 GAACGACCAGCTGGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAA 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAACGACCAGCTGGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAA 1036
Query 959 CCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATG 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATG 1110
Query 1033 TCCGTCACCATCACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACT 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCGTCACCATCACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACT 1184
Query 1107 GAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACA 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACA 1258
Query 1181 CTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAG 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAG 1332
Query 1255 CTGAAAGTGATCCGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAG 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGAAAGTGATCCGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAG 1406
Query 1329 CGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCA 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCA 1480
Query 1403 TCGAAGACGATTTGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTA 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCGAAGACGATTTGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTA 1554
Query 1477 GCTGCATCTACAAATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGG 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCTGCATCTACAAATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGG 1628
Query 1551 CCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTAC 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTAC 1702
Query 1625 ATCCCAGTGGGGACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTT 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATCCCAGTGGGGACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTT 1776
Query 1699 AAGACAAAAATTGGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGT 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGACAAAAATTGGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGT 1850
Query 1773 TGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAG 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAG 1924
Query 1847 GAAATGGGGACAGGCAGTTTGCA------------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATT 1908
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GAAATGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTACACTCGATGGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATT 1998
Query 1909 ATTATTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTC 1982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATTATTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTC 2072
Query 1983 AAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGG 2056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGG 2146
Query 2057 CCGACTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCT 2130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCGACTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCT 2220
Query 2131 GACCCACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCA 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GACCCACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCA 2294
Query 2205 CTGTTTCAAAGTCTATCGATACTTACAG 2232
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTGTTTCAAAGTCTATCGATACTTACAG 2322