Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02752
- Subject:
- XM_011240297.2
- Aligned Length:
- 2310
- Identities:
- 2030
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCCAG 8
||||||||
Sbjct 1 ATGGGCACATGGGAAGGGCAGCGTGCAGGGTCGAGGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTCTAGGATGGCCAG 74
Query 9 TGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGG 82
|||.|||.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGGGCGCCAGCATCCCAAGTCCCGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATCTGCAGTATATGCCTGG 148
Query 83 AACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCT 156
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 AACGGTACAAGAACCCCAAGGTCCTGCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATCCCA 222
Query 157 GCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCT 230
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCGGTGTGTCGCCAGACATCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCACT 296
Query 231 CCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTT 304
.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||..|||||.||||
Sbjct 297 TCAGAACAACTTCTTTATCACGAACCTCATGGATGTGCTGCAGCGGACGCCAGGCAGCAACGGCGAGGACTCTT 370
Query 305 CCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATG 378
|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 CCATCCTGGAGACGGTCACCGCTGTGGCTGCAGGAAAGCCTCTTTCGTGCCCAAACCATGATGGAAATGTGATG 444
Query 379 GAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCAC 452
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 GAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACCGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCGGAGCACCCCAC 518
Query 453 AGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGC 526
|||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 519 AGTCCCGCTGAAGGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGACGCAGTCAACAAAAGAC 592
Query 527 TCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 TCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCAGAAATCATCCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATT 666
Query 601 GTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGA 674
|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 GTGGATGACATCCACTCCACCTTTGATGAGCTGCAGAAGACTTTAAATGTTCGCAAGAGCGTGCTGCTCATGGA 740
Query 675 ATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGA 748
.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 741 GTTGGAGGTCAACTATGGTCTCAAACACAAAGTGCTGCAGTCGCAGCTGGATACCCTGCTCCAAGGCCAGGAAA 814
Query 749 GCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAG 822
|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 815 GCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACGGCTCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACGGAGGTGCTGCTGGTGAAG 888
Query 823 AAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCT 896
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAACTGGCGGACCAGGACTTCCCACTGCACCCGCGCGAGAACGACCAGCT 962
Query 897 GGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCG 970
||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.|
Sbjct 963 GGATTTTATCGTGGAAACGGAGGGACTGAAGAAGTCTATCCACAACCTGGGGACCATCCTCACCACTAACGCGG 1036
Query 971 TTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATC 1044
|.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1037 TCGCCTCTGAGACGGTGGCCACGGGGGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTTACTATA 1110
Query 1045 ACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGA 1118
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1111 ACCACCAAGGACAAAGACGGAGAGCTGTGCAAGACAGGCAACGCATACCTCACCGCTGAGCTCAGCACCCCGGA 1184
Query 1119 CGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGG 1192
|||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185 CGGCAGCGTGGCCGACGGAGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTACGAGTTCTTGTATACTGTGCAGAAGG 1258
Query 1193 AAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATC 1266
|.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1259 AGGGGGACTTCACCCTGTCCCTCAGGCTCTACGACCAGCATATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTCAAGGTCATC 1332
Query 1267 CGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAA 1340
||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 CGCTCTGCCGACGTGTCCCCCACCACCGAGGGCGTGAAGCGACGAGTCAAGTCCCCGGGGAGCGGGCACGTCAA 1406
Query 1341 GCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATT 1414
||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||..
Sbjct 1407 GCAGAAGGCTGTGAAGAGACCTGCCAGCATGTACAGCACCGGCAAGCGAAAAGAGAACCCCATCGAGGACGACC 1480
Query 1415 TGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACA 1488
|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1481 TGATCTTCCGAGTCGGTACCAAAGGAAGAAACAAAGGAGAATTTACAAACCTGCAGGGTGTGGCTGCATCTACA 1554
Query 1489 AATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAG 1562
|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 AGTGGAAAGATATTAATTGCAGATAGTAACAACCAGTGTGTGCAGATCTTTTCCAATGATGGACAGTTCAAAAG 1628
Query 1563 TCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGG 1636
||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1629 TCGTTTCGGCATCCGAGGACGATCACCCGGACAGCTCCAGCGGCCCACGGGGGTAGCGGTGCACCCCAGTGGGG 1702
Query 1637 ACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATT 1710
||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703 ACATCATCATTGCAGATTATGACAACAAGTGGGTTAGCATTTTCTCCAATGATGGGAAGTTTAAGACAAAAATT 1776
Query 1711 GGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAA 1784
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 GGATCAGGAAAACTGATGGGGCCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTGGTGGACAACAA 1850
Query 1785 GGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACA 1858
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1851 GGCGTGCTGTGTGTTTATCTTCCAGCCCAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAACGGGGACA 1924
Query 1859 GGCAGTTTGCA------------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGAT 1920
||||||||||| ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1925 GGCAGTTTGCAGGTACACTCGATGGTCCCCACTTTGCAGCTGTGAATAGCAATAATGAGATCATCATTACAGAT 1998
Query 1921 TTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGG 1994
|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1999 TTCCATAATCACTCTGTCAAGGTATTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCCAATGGAGAAGG 2072
Query 1995 AAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAA 2068
||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2073 AAATGGGCAGTTTAATGCACCAACAGGTGTGGCCGTGGACTCAAATGGGAACATCATTGTGGCTGACTGGGGGA 2146
Query 2069 ACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTAT 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147 ACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTATATCAACACATCTGCTGACCCGCTCTAT 2220
Query 2143 GGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGT 2216
||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 2221 GGCCCCCAGGGCCTGGCTCTCACTTCAGATGGCCATGTTGTGGTTGCAGACTCCGGAAACCACTGTTTCAAGGT 2294
Query 2217 CTATCGATACTTACAG 2232
|||.||.|||||||||
Sbjct 2295 CTACCGGTACTTACAG 2310