Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02752
• Subject: XM_011240298.2
• Aligned Length: 2298
• Identities: 2030
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGGCCAGTGAAGGCACCAA  20
                                                                  |||||||||||.|||.|||.
Sbjct    1  ATGCAGCAGCGTGCAGGGTCGAGGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTCTAGGATGGCCAGTGAGGGCGCCAG  74

Query   21  CATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGA  94
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCCCAAGTCCCGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATCTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGA  148

Query   95  ATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCTGCCCACAGTTTA  168
            |.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  ACCCCAAGGTCCTGCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATCCCAGCCCACAGTTTA  222

Query  169  ACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTT  242
            ||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  ACCCTCTCCTGCCCGGTGTGTCGCCAGACATCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCACTTCAGAACAACTT  296

Query  243  CTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGA  316
            |||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||..|||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTTATCACGAACCTCATGGATGTGCTGCAGCGGACGCCAGGCAGCAACGGCGAGGACTCTTCCATCCTGGAGA  370

Query  317  CAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATGGAATTTTACTGC  390
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGTCACCGCTGTGGCTGCAGGAAAGCCTCTTTCGTGCCCAAACCATGATGGAAATGTGATGGAATTTTACTGC  444

Query  391  CAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCACAGTTCCACTCAA  464
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  445  CAGTCCTGTGAGACCGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCGGAGCACCCCACAGTCCCGCTGAA  518

Query  465  GGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAG  538
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGACGCAGTCAACAAAAGACTCCCAGAAATAG  592

Query  539  ATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATCGTGGATGACATT  612
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  593  ATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCAGAAATCATCCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATTGTGGATGACATC  666

Query  613  CATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAA  686
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  667  CACTCCACCTTTGATGAGCTGCAGAAGACTTTAAATGTTCGCAAGAGCGTGCTGCTCATGGAGTTGGAGGTCAA  740

Query  687  CTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCT  760
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  CTATGGTCTCAAACACAAAGTGCTGCAGTCGCAGCTGGATACCCTGCTCCAAGGCCAGGAAAGCATTAAGAGCT  814

Query  761  GCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGC  834
            |||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGCAACTTCACGGCTCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACGGAGGTGCTGCTGGTGAAGAAGCAGATGAGC  888

Query  835  GAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCTGGATTTCATCGT  908
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  GAGAAGCTGAACGAACTGGCGGACCAGGACTTCCCACTGCACCCGCGCGAGAACGACCAGCTGGATTTTATCGT  962

Query  909  GGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGA  982
            ||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  963  GGAAACGGAGGGACTGAAGAAGTCTATCCACAACCTGGGGACCATCCTCACCACTAACGCGGTCGCCTCTGAGA  1036

Query  983  CAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATCACCACCAAGGAC  1056
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  CGGTGGCCACGGGGGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTTACTATAACCACCAAGGAC  1110

Query 1057  AAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGC  1130
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  AAAGACGGAGAGCTGTGCAAGACAGGCAACGCATACCTCACCGCTGAGCTCAGCACCCCGGACGGCAGCGTGGC  1184

Query 1131  AGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTA  1204
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185  CGACGGAGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTACGAGTTCTTGTATACTGTGCAGAAGGAGGGGGACTTCA  1258

Query 1205  CCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATCCGATCCGCTGAT  1278
            |||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1259  CCCTGTCCCTCAGGCTCTACGACCAGCATATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTCAAGGTCATCCGCTCTGCCGAC  1332

Query 1279  GTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGT  1352
            |||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1333  GTGTCCCCCACCACCGAGGGCGTGAAGCGACGAGTCAAGTCCCCGGGGAGCGGGCACGTCAAGCAGAAGGCTGT  1406

Query 1353  GAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATTTGATCTTTCGAG  1426
            |||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||||||.||||
Sbjct 1407  GAAGAGACCTGCCAGCATGTACAGCACCGGCAAGCGAAAAGAGAACCCCATCGAGGACGACCTGATCTTCCGAG  1480

Query 1427  TGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACAAATGGAAAGATA  1500
            |.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1481  TCGGTACCAAAGGAAGAAACAAAGGAGAATTTACAAACCTGCAGGGTGTGGCTGCATCTACAAGTGGAAAGATA  1554

Query 1501  TTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCAT  1574
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555  TTAATTGCAGATAGTAACAACCAGTGTGTGCAGATCTTTTCCAATGATGGACAGTTCAAAAGTCGTTTCGGCAT  1628

Query 1575  ACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGGACATAATCATTG  1648
            .||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  CCGAGGACGATCACCCGGACAGCTCCAGCGGCCCACGGGGGTAGCGGTGCACCCCAGTGGGGACATCATCATTG  1702

Query 1649  CCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAG  1722
            |.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1703  CAGATTATGACAACAAGTGGGTTAGCATTTTCTCCAATGATGGGAAGTTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAA  1776

Query 1723  CTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGT  1796
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1777  CTGATGGGGCCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTGGTGGACAACAAGGCGTGCTGTGT  1850

Query 1797  GTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAGGCAGTTTGCA-  1869
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||| 
Sbjct 1851  GTTTATCTTCCAGCCCAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAACGGGGACAGGCAGTTTGCAG  1924

Query 1870  -----------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGATTTCCATAATCAT  1932
                       ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925  GTACACTCGATGGTCCCCACTTTGCAGCTGTGAATAGCAATAATGAGATCATCATTACAGATTTCCATAATCAC  1998

Query 1933  TCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTT  2006
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCTGTCAAGGTATTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCCAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTT  2072

Query 2007  TAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAAACAGCAGGATCC  2080
            ||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2073  TAATGCACCAACAGGTGTGGCCGTGGACTCAAATGGGAACATCATTGTGGCTGACTGGGGGAACAGCAGGATCC  2146

Query 2081  AGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTATGGCCCCCAAGGC  2154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 2147  AGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTATATCAACACATCTGCTGACCCGCTCTATGGCCCCCAGGGC  2220

Query 2155  CTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGTCTATCGATACTT  2228
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 2221  CTGGCTCTCACTTCAGATGGCCATGTTGTGGTTGCAGACTCCGGAAACCACTGTTTCAAGGTCTACCGGTACTT  2294

Query 2229  ACAG  2232
            ||||
Sbjct 2295  ACAG  2298