Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02752
• Subject: XM_011240301.2
• Aligned Length: 2244
• Identities: 2030
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCCAGTGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTAT  74
            |||||||||||.|||.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGTGAGGGCGCCAGCATCCCAAGTCCCGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATCTGCAGTAT  74

Query   75  ATGCCTGGAACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACT  148
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATGCCTGGAACGGTACAAGAACCCCAAGGTCCTGCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACT  148

Query  149  ACATTCCTGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTG  222
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATCCCAGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCGGTGTGTCGCCAGACATCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTG  222

Query  223  GCCGCGCTCCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGA  296
            |||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||..||
Sbjct  223  GCCGCACTTCAGAACAACTTCTTTATCACGAACCTCATGGATGTGCTGCAGCGGACGCCAGGCAGCAACGGCGA  296

Query  297  GGAGTCTTCCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGA  370
            |||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  297  GGACTCTTCCATCCTGGAGACGGTCACCGCTGTGGCTGCAGGAAAGCCTCTTTCGTGCCCAAACCATGATGGAA  370

Query  371  ATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  ATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACCGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCGGAG  444

Query  445  CACCCCACAGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAA  518
            |||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  CACCCCACAGTCCCGCTGAAGGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGACGCAGTCAA  518

Query  519  CAAAAGGCTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGG  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAAAGACTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCAGAAATCATCCATCAGTTAACCAACCAAAAGG  592

Query  593  CCAGCATCGTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTG  666
            |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  CCAGCATTGTGGATGACATCCACTCCACCTTTGATGAGCTGCAGAAGACTTTAAATGTTCGCAAGAGCGTGCTG  666

Query  667  CTTATGGAATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGG  740
            ||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  CTCATGGAGTTGGAGGTCAACTATGGTCTCAAACACAAAGTGCTGCAGTCGCAGCTGGATACCCTGCTCCAAGG  740

Query  741  GCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTAC  814
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  CCAGGAAAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACGGCTCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACGGAGGTGCTGC  814

Query  815  TGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||
Sbjct  815  TGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAACTGGCGGACCAGGACTTCCCACTGCACCCGCGCGAGAAC  888

Query  889  GACCAGCTGGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCAC  962
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||
Sbjct  889  GACCAGCTGGATTTTATCGTGGAAACGGAGGGACTGAAGAAGTCTATCCACAACCTGGGGACCATCCTCACCAC  962

Query  963  CAACGCCGTTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCG  1036
            .|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAACGCGGTCGCCTCTGAGACGGTGGCCACGGGGGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCG  1036

Query 1037  TCACCATCACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGC  1110
            |.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1037  TTACTATAACCACCAAGGACAAAGACGGAGAGCTGTGCAAGACAGGCAACGCATACCTCACCGCTGAGCTCAGC  1110

Query 1111  ACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGT  1184
            |||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  ACCCCGGACGGCAGCGTGGCCGACGGAGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTACGAGTTCTTGTATACTGT  1184

Query 1185  CCAGAAGGAAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGA  1258
            .||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  GCAGAAGGAGGGGGACTTCACCCTGTCCCTCAGGCTCTACGACCAGCATATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTCA  1258

Query 1259  AAGTGATCCGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGC  1332
            |.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259  AGGTCATCCGCTCTGCCGACGTGTCCCCCACCACCGAGGGCGTGAAGCGACGAGTCAAGTCCCCGGGGAGCGGG  1332

Query 1333  CACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGA  1406
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  CACGTCAAGCAGAAGGCTGTGAAGAGACCTGCCAGCATGTACAGCACCGGCAAGCGAAAAGAGAACCCCATCGA  1406

Query 1407  AGACGATTTGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTG  1480
            .|||||..|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 1407  GGACGACCTGATCTTCCGAGTCGGTACCAAAGGAAGAAACAAAGGAGAATTTACAAACCTGCAGGGTGTGGCTG  1480

Query 1481  CATCTACAAATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAG  1554
            |||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1481  CATCTACAAGTGGAAAGATATTAATTGCAGATAGTAACAACCAGTGTGTGCAGATCTTTTCCAATGATGGACAG  1554

Query 1555  TTCAAAAGTCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCC  1628
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 1555  TTCAAAAGTCGTTTCGGCATCCGAGGACGATCACCCGGACAGCTCCAGCGGCCCACGGGGGTAGCGGTGCACCC  1628

Query 1629  CAGTGGGGACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGA  1702
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.|||||||
Sbjct 1629  CAGTGGGGACATCATCATTGCAGATTATGACAACAAGTGGGTTAGCATTTTCTCCAATGATGGGAAGTTTAAGA  1702

Query 1703  CAAAAATTGGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTG  1776
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  CAAAAATTGGATCAGGAAAACTGATGGGGCCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTGGTG  1776

Query 1777  GACAACAAGGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAA  1850
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACAACAAGGCGTGCTGTGTGTTTATCTTCCAGCCCAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAA  1850

Query 1851  TGGGGACAGGCAGTTTGCA------------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTA  1912
            .||||||||||||||||||            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1851  CGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTACACTCGATGGTCCCCACTTTGCAGCTGTGAATAGCAATAATGAGATCATCA  1924

Query 1913  TTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAAT  1986
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1925  TTACAGATTTCCATAATCACTCTGTCAAGGTATTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCCAAT  1998

Query 1987  GGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGA  2060
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1999  GGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCACCAACAGGTGTGGCCGTGGACTCAAATGGGAACATCATTGTGGCTGA  2072

Query 2061  CTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACC  2134
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTGGGGGAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTATATCAACACATCTGCTGACC  2146

Query 2135  CACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGT  2208
            |.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2147  CGCTCTATGGCCCCCAGGGCCTGGCTCTCACTTCAGATGGCCATGTTGTGGTTGCAGACTCCGGAAACCACTGT  2220

Query 2209  TTCAAAGTCTATCGATACTTACAG  2232
            |||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 2221  TTCAAGGTCTACCGGTACTTACAG  2244