Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02758
• Subject: NM_172554.2
• Aligned Length: 1896
• Identities: 1749
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGCGGGAGGAGGGATTTAACACCAAGATGGCGGACGGCCCGGATGAGTACGATACCGAAGCGGGCTGTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||
Sbjct    1  ATGCAGCGGGAGGAGGGATTTAACACCAAGATGGCGGACGGCCCGGATGAGTACGAGACCGAAACGGGCTGCGT  74

Query   75  GCCCCTTCTCCACCCAGAGGAAATCAAACCCCAAAGCCATTATAACCATGGATATGGTGAACCTCTTGGACGGA  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  GCCCCTTCTCCACCCGGAGGAAATCAAACCACAGAGCCACTATAACCATGGCTATGGAGAACCTCTTGGTCGGA  148

Query  149  AAACTCATATTGATGATTACAGCACATGGGACATAGTCAAGGCTACACAATATGGAATATATGAACGCTGTCGA  222
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AAACTCATATTGATGACTATAGCACATGGGACATCGTCAAGGCGACACAATATGGAATATATGAACGCTGCCGA  222

Query  223  GAATTGGTGGAAGCAGGTTATGATGTACGGCAACCGGACAAAGAAAATGTTACCCTCCTCCATTGGGCTGCCAT  296
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  GAATTGGTGGAAGCGGGTTACGATGTACGGCAACCAGACAAAGAAAATGTTACACTTCTTCATTGGGCTGCCAT  296

Query  297  CAATAACAGAATAGATTTAGTCAAATACTATATTTCGAAAGGTGCTATTGTGGATCAACTTGGAGGGGACCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CAATAACAGAATAGATTTAGTCAAATACTATATTTCGAAAGGTGCTATTGTGGATCAACTTGGAGGAGACCTGA  370

Query  371  ATTCAACTCCATTGCACTGGGCCACAAGACAAGGCCATCTATCCATGGTTGTGCAACTAATGAAATATGGTGCA  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCAACTCCGTTGCACTGGGCCACAAGACAAGGCCATTTATCCATGGTTGTACAACTAATGAAATATGGTGCA  444

Query  445  GATCCTTCATTAATTGATGGAGAAGGATGTAGCTGTATTCATCTGGCTGCTCAGTTCGGACATACCTCAATTGT  518
            ||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCCCTCCTTAATTGATGGGGAAGGATGCAGCTGTATCCACTTGGCTGCTCAGTTCGGACATACCTCAATTGT  518

Query  519  TGCTTATCTCATAGCAAAAGGACAGGATGTAGATATGATGGATCAGAATGGAATGACGCCTTTAATGTGGGCAG  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTTATCTTATAGCAAAAGGACAGGATGTAGATATGATGGATCAGAATGGAATGACCCCTTTAATGTGGGCAG  592

Query  593  CATATAGAACACATAGTGTGGATCCAACTAGATTGCTTTTAACATTCAATGTTTCAGTTAACCTTGGTGACAAG  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTATAGAACACATAGTGTGGATCCAACTAGATTGCTTTTAACATTCAATGTTTCAGTTAACCTTGGTGACAAG  666

Query  667  TATCACAAAAACACTGCTCTGCATTGGGCAGTGCTAGCAGGGAATACCACAGTCATTAGCCTTCTTCTGGAAGC  740
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  TATCACAAAAACACTGCTCTGCACTGGGCAGTCCTAGCAGGGAACACCACAGTCATTAGTCTTCTTCTGGAAGC  740

Query  741  TGGAGCTAATGTTGATGCCCAGAATATCAAGGGCGAATCAGCGCTTGATTTGGCAAAACAGAGAAAAAATGTGT  814
            .||||..|||||.||.||||||||..|||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  741  CGGAGGCAATGTGGACGCCCAGAACGTCAAGGGTGAGTCAGCACTTGATTTGGCAAAGCAAAGAAAAAACGTGT  814

Query  815  GGATGATCAACCACTTACAAGAGGCAAGGCAAGCAAAAGGATATGACAATCCGTCCTTCCTTAGAAAGCTGAAA  888
            |||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  GGATGATCAACCATTTGCAGGAGGCAAGGCAAGCGAAAGGGTATGACAACCCATCCTTCCTCAGAAAGCTGAAG  888

Query  889  GCTGATAAGGAATTTCGGCAGAAAGTAATGTTAGGAACTCCTTTCCTAGTTATTTGGCTGGTTGGGTTTATAGC  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GCTGACAAGGAATTTCGGCAGAAAGTAATGCTGGGAACCCCATTCCTGGTGATCTGGCTGGTCGGGTTTATAGC  962

Query  963  AGACCTAAATATTGATTCTTGGCTCATTAAAGGGCTAATGTATGGTGGTGTTTGGGCTACAGTACAGTTTCTTT  1036
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  963  AGACCTAGACATTGATTCTTGGCTCATTAAAGGGTTAATGTATGGTGGCGTTTGGGCTACAGTGCAATTTCTTT  1036

Query 1037  CAAAATCCTTTTTCGATCATTCAATGCATAGTGCATTGCCCCTTGGGATATATTTGGCAACCAAATTCTGGATG  1110
            |.||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAGTCCTTCTTTGACCATTCAATGCACAGCGCATTGCCCCTTGGGATATATTTGGCAACCAAATTCTGGATG  1110

Query 1111  TATGTGACGTGGTTCTTCTGGTTTTGGAATGATCTCAACTTTTTATTTATCCATCTTCCATTCCTTGCCAATAG  1184
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||.|||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  TATGTGACATGGTTCTTCTGGTTCTGGAATGATCTCAACTTCCTGTTCATCCACCTCCCCTTCCTTGCCAACAG  1184

Query 1185  TGTTGCACTTTTCTACAATTTTGGAAAATCTTGGAAATCAGATCCAGGGATTATTAAAGCAACAGAAGAGCAAA  1258
            .|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185  CGTTGCTCTTTTCTACAATTTTGGAAAGTCTTGGAAATCAGATCCAGGGATTATTAAAGCTACAGAAGAACAAA  1258

Query 1259  AGAAAAAGACAATAGTTGAACTTGCAGAGACAGGAAGTCTGGACCTCAGTATATTCTGCAGTACCTGTTTGATA  1332
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1259  AGAAAAAGACGATAGTTGAACTTGCAGAGACTGGAAGTCTGGACCTCAGTATATTCTGCAGTACCTGCTTGATT  1332

Query 1333  CGAAAACCGGTGAGGTCCAAACATTGTGGTGTGTGCAACCGCTGTATAGCAAAATTTGATCATCATTGCCCATG  1406
            ||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CGGAAGCCAGTGAGGTCCAAACACTGTGGTGTGTGCAACCGCTGTATAGCGAAATTTGATCACCATTGCCCATG  1406

Query 1407  GGTGGGTAACTGTGTAGGTGCAGGCAACCATAGATATTTTATGGGCTACCTATTCTTCTTGCTTTTTATGATCT  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  GGTGGGTAACTGTGTAGGTGCAGGCAACCATAGGTACTTTATGGGGTACCTGTTCTTCTTGCTTTTCATGATCT  1480

Query 1481  GCTGGATGATTTATGGTTGTATATCTTACTGGGGACTCCACTGTGAGACCACTTACACCAAGGATGGATTTTGG  1554
            ||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  GCTGGATGATCTATGGTTGTGTCTCTTACTGGGGCCTTCACTGTGAGACCACGTACACCAAGGATGGGTTTTGG  1554

Query 1555  ACATACATTACTCAGATTGCCACGTGTTCACCTTGGATGTTTTGGATGTTCCTGAACAGTGTTTTCCACTTCAT  1628
            ||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||.|
Sbjct 1555  ACATACATAACTCAGATCGCCACATGCTCCCCGTGGATGTTCTGGATGTTTCTCAACAGTGTGTTTCACTTCCT  1628

Query 1629  GTGGGTGGCTGTATTACTCATGTGTCAGATGTACCAGATATCATGTTTAGGTATTACTACAAATGAAAGAATGA  1702
            |||||||||.||..|.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGGGTGGCCGTGCTGCTCATGTGTCAGCTGTACCAGATAACATGTTTAGGTATTACTACAAATGAAAGAATGA  1702

Query 1703  ATGCCAGGAGATACAAGCACTTTAAAGTCACAACAACGTCTATTGAAAGCCCATTCAACCATGGATGTGTAAGA  1776
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1703  ACGCCAGGAGATACAAGCACTTTAAAGTTACGACAACATCTATTGAAAGCCCATTCAACCATGGATGTGTAAGG  1776

Query 1777  AATATTATAGACTTCTTTGAATTTCGATGCTGTGGCCTCTTTCGTCCTGTTATCGTGGACTGGACCAGGCAGTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AATATTATAGACTTCTTTGAATTTCGATGCTGTGGCCTCTTTCGTCCTGTTATCGTGGACTGGACCAGGCAGTA  1850

Query 1851  TACAATAGAATATGACCAAATATCAGGATCTGGGTACCAGCTGGTG  1896
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1851  CACTATAGAATATGACCAAATATCAGGATCTGGGTACCAGCTTGTG  1896