Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02790
- Subject:
- XM_017316811.1
- Aligned Length:
- 1315
- Identities:
- 999
- Gaps:
- 215
Alignment
Query 1 ---------------ATGGAGAAAAAGAAAATG----GTAACTC-----AGGGTAACCAGGAGCCGACAACAAC 50
|||||..| | |.|||.| ||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGTCATCAGATTCCATGGACCA---------GCCCAGGAACCCCTGCGAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAAC 65
Query 51 TCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGT 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 66 TCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAAT 139
Query 125 ATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAA 198
||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |
Sbjct 140 ATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-A 212
Query 199 GCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCAC 268
||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.|| |||||||||||||||||
Sbjct 213 GCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCAC 286
Query 269 AGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCAT 342
||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||
Sbjct 287 AGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACAT 360
Query 343 GTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGA 416
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGA 434
Query 417 TGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAG 490
|||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAG 508
Query 491 ACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGT 564
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 509 ACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGG 582
Query 565 GTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATA 638
||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 583 GTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTA 656
Query 639 TGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTAT 712
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|
Sbjct 657 TGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGT 730
Query 713 CAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACT 786
||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 731 CAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACT 804
Query 787 GCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCG 860
|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 805 GCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCG 878
Query 861 AGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCT 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 AGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCT 952
Query 935 AT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA------------------------------CAGATATGCAC 964
|| |.|| ||.||| ||..||| |.||||| .||
Sbjct 953 ATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AAC 1025
Query 965 AGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCC 1011
|| .| |.|||||| || || ||||..||| |.|.|| .
Sbjct 1026 AG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----G 1084
Query 1012 GC-----TTAC------------------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC- 1050
|| |||| ||.||| .||||.||.|.|| ||| ||.|| |..|||
Sbjct 1085 GCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACT 1158
Query 1051 --------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TA 1109
|| .|||||.|.|.|||...|||| |||| ||| |.|.|||..|||||| || .|
Sbjct 1159 GACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCA 1222
Query 1110 CCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTTGCCCCCTAC------------ 1140
||||| |||| ||.|| |||.|.| |||.|.
Sbjct 1223 CCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA 1275