Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02816
- Subject:
- NM_001321961.2
- Aligned Length:
- 1398
- Identities:
- 1338
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGGGCTGGATCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGTCATTTTTTCCCTGGAGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCTGGATCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGTCATTTTTTCCCTGGAGGA 74
Query 75 ACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCCGGGATTTAAAAATTCTCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCCGGGATTTAAAAATTCTCT 148
Query 149 ATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTTGAATATTTGAATTTAGCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTTGAATATTTGAATTTAGCT 222
Query 223 TTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACTTGACCTGACTGTGAATTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACTTGACCTGACTGTGAATTT 296
Query 297 CATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGCTCTTTCTCATGGGGAACC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGCTCTTTCTCATGGGGAACC 370
Query 371 CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA 444
Query 445 GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA 518
Query 519 AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG 592
Query 593 AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG 666
Query 667 AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT 740
Query 741 GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC 814
Query 815 GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG 888
Query 889 AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAAGCAGATCATCCTGGACCT 962
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAA------------------------------------------------ 914
Query 963 TGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 ------------GTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA 976
Query 1037 AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA 1050
Query 1111 ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT 1124
Query 1185 GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC 1198
Query 1259 CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA 1272
Query 1333 CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT 1338