Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02816
• Subject: XM_006716538.3
• Aligned Length: 1416
• Identities: 1396
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGG----CTGGA--------------TCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGT  56
            |||.|    .||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGTGTAATGGATGAGACACCACATGTCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGT  74

Query   57  CATTTTTTCCCTGGAGGAACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCC  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATTTTTTCCCTGGAGGAACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCC  148

Query  131  GGGATTTAAAAATTCTCTATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTT  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGATTTAAAAATTCTCTATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTT  222

Query  205  GAATATTTGAATTTAGCTTTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACT  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAATATTTGAATTTAGCTTTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACT  296

Query  279  TGACCTGACTGTGAATTTCATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGC  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTGACTGTGAATTTCATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGC  370

Query  353  TCTTTCTCATGGGGAACCCATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTA  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTTTCTCATGGGGAACCCATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTA  444

Query  427  AAGTGGTTGGATGGTAAAGAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACC  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTGGTTGGATGGTAAAGAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACC  518

Query  501  ACAAATCAGAGAGCAGGAAAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACC  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAAATCAGAGAGCAGGAAAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACC  592

Query  575  AAGAAGAGGATAAAAATGAAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCT  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAAGAGGATAAAAATGAAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCT  666

Query  649  ACTCTTTCCTCTTTAGAGAGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTCTTTCCTCTTTAGAGAGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGA  740

Query  723  CAACAGTGAAGATGACTTGGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTA  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACAGTGAAGATGACTTGGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTA  814

Query  797  GACACATGGAAAAACAACGGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACACATGGAAAAACAACGGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACT  888

Query  871  TTGATCACTGAAGATGGGAAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAA  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGATCACTGAAGATGGGAAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAA  962

Query  945  GCAGATCATCCTGGACCTTGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTT  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGATCATCCTGGACCTTGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTT  1036

Query 1019  ACGTGCGAGTAATGATCAAAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCT  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGTGCGAGTAATGATCAAAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCT  1110

Query 1093  GCTAAAAGATCTCAGACAACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTAAAAGATCTCAGACAACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCA  1184

Query 1167  GCGAGCATTCAAATCTATGAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGG  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCGAGCATTCAAATCTATGAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGG  1258

Query 1241  AGAAACTAGAAGTAGACCCTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACA  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAAACTAGAAGTAGACCCTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACA  1332

Query 1315  CCCAGAAGACGACCTGAACCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCC  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCAGAAGACGACCTGAACCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCC  1406

Query 1389  TCCGCTGATT  1398
            ||||||||||
Sbjct 1407  TCCGCTGATT  1416