Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02826
• Subject: XM_006500776.3
• Aligned Length: 1509
• Identities: 1264
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGGTCAGAAAGCCTGTTGTGTCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGAAATGTTAACGGGAGGCTGCC  74
                                                                   |||  |.||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------ATG--AGCGGGAGGCTGCC  17

Query   75  TTCCCTGGGCAACAAGGAGCCACCTGGGCAGGAGAAAGTGCAG--CTGAAGAGGAAAGTCACTTTACTGAGGGG  146
            .|||.||||..||.|.||||||||||||||||||||.||  ||  |||||.|.|||..|||||||.||||||||
Sbjct   18  CTCCATGGGGGACCAAGAGCCACCTGGGCAGGAGAAGGT--AGTTCTGAAAAAGAAGATCACTTTGCTGAGGGG  89

Query  147  AGTCTCCATTATCATTGGCACCATCATTGGAGCAGGAATCTTCATCTCTCCTAAGGGCGTGCTCCAGAACACGG  220
            .||||||||.|||||.||||||.||||.|||.||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||
Sbjct   90  GGTCTCCATCATCATCGGCACCGTCATCGGATCAGGCATCTTCATCTCCCCCAAGGGCATACTCCAGAACACGG  163

Query  221  GCAGCGTGGGCATGTCTCTGACCATCTGGACGGTGTGTGGGGTCCTGTCACTATTTGGAGCTTTGTCTTATGCT  294
            ||||||||||||||||.|||....|||||.|.|..|||||.||.||||||||.||||||||..||||.|||||.
Sbjct  164  GCAGCGTGGGCATGTCCCTGGTTTTCTGGTCTGCCTGTGGAGTACTGTCACTTTTTGGAGCCCTGTCCTATGCA  237

Query  295  GAATTGGGAACAACTATAAAGAAATCTGGAGGTCATTACACATATATTTTGGAAGTCTTTGGTCCATTACCAGC  368
            |||||.||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||.|..||
Sbjct  238  GAATTAGGTACAAGCATAAAGAAATCTGGTGGTCATTACACATACATTCTGGAGGTCTTTGGTCCTTTGCTGGC  311

Query  369  TTTTGTACGAGTCTGGGTGGAACTCCTCATAATACGCCCTGCAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTTGGAC  442
            ||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  TTTTGTTCGAGTCTGGGTGGAACTGCTCGTAATACGCCCTGGAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTTGGAC  385

Query  443  GCTACATTCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATCCCTGAACTTGCGATCAAGCTCATTACAGCTGTGGGC  516
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||
Sbjct  386  GCTACATCCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATTCCTGAACTTGCAATCAAGCTCGTGACAGCTGTGGGC  459

Query  517  ATAACTGTAGTGATGGTCCTAAATAGCATGAGTGTCAGCTGGAGCGCCCGGATCCAGATTTTCTTAACCTTTTG  590
            ||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  460  ATCACTGTGGTGATGGTCCTAAATAGCACGAGTGTCAGCTGGAGTGCCCGGATCCAGATTTTCCTAACCTTTTG  533

Query  591  CAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATGCAGCTAATTAAAGGTCAAACGCAGAACTTTA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||..||||||
Sbjct  534  CAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATACAGCTAATTAAAGGGCAAACACATCACTTTA  607

Query  665  AAGACGCCTTTTCAGGAAGAGATTCAAGTATTACGCGGTTGCCACTGGCTTTTTATTATGGAATGTATGCATAT  738
            ||||.||.||||||||||||||..|||||.|.|.|.|||||||..||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  608  AAGATGCATTTTCAGGAAGAGACACAAGTCTAATGGGGTTGCCCTTGGCTTTTTATTATGGGATGTATGCATAT  681

Query  739  GCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTGTTACTGAAGAAGTAGAAAACCCTGAAAAAACCATTCCCCTTGCAATATG  812
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  682  GCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTATTACTGAAGAAGTAGACAACCCTGAAAAAACCATCCCCCTTGCAATCTG  755

Query  813  TATATCCATGGCCATTGTCACCATTGGCTATGTGCTGACAAATGTGGCCTACTTTACGACCATTAATGCTGAGG  886
            .||.||||||||.||..||||..|.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|.|||.||||
Sbjct  756  CATCTCCATGGCTATCATCACAGTGGGCTACGTACTGACAAACGTGGCCTATTTTACCACCATCAGTGCGGAGG  829

Query  887  AGCTGCTGCTTTCAAATGCAGTGGCAGTGACCTTTTCTGAGCGGCTACTGGGAAATTTCTCATTAGCAGTTCCG  960
            |||||||||..||.|..||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  830  AGCTGCTGCAGTCCAGCGCCGTGGCGGTGACCTTCTCTGAGCGGCTGCTGGGAAAATTCTCATTAGCAGTCCCG  903

Query  961  ATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTTGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTTGCTGTCTCCAGGTTATTCTATGTTGC  1034
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  904  ATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTCGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTCGCTGTCTCCAGGTTATTCTACGTCGC  977

Query 1035  GTCTCGAGAGGGTCACCTTCCAGAAATCCTCTCCATGATTCATGTCCGCAAGCACACTCCTCTACCAGCTGTTA  1108
            .||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  978  ATCTCGAGAAGGGCACCTTCCGGAAATCCTCTCTATGATTCATGTCCACAAGCACACTCCTCTGCCAGCTGTTA  1051

Query 1109  TTGTTTTGCACCCTTTGACAATGATAATGCTCTTCTCTGGAGACCTCGACAGTCTTTTGAATTTCCTCAGTTTT  1182
            ||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||.|.||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1052  TTGTTTTGCATCCTCTGACGATGGTGATGCTCTTCTCCGGAGACCTCTATAGTCTTCTAAATTTCCTCAGTTTT  1125

Query 1183  GCCAGGTGGCTTTTTATTGGGCTGGCAGTTGCTGGGCTGATTTATCTTCGATACAAATGCCCAGATATGCATCG  1256
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1126  GCCAGGTGGCTTTTTATGGGGCTGGCAGTCGCAGGACTGATTTATCTTCGATACAAACGCCCAGATATGCATCG  1199

Query 1257  TCCTTTCAAGGTGCCACTGTTCATCCCAGCTTTGTTTTCCTTCACATGCCTCTTCATGGTTGCCCTTTCCCTCT  1330
            |||||||||||||||.||.||||||||.||..|.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.|
Sbjct 1200  TCCTTTCAAGGTGCCTCTCTTCATCCCGGCACTATTTTCCTTCACCTGCCTCTTCATGGTTGTCCTCTCTCTTT  1273

Query 1331  ATTCGGACCCATTTAGTACAGGGATTGGCTTCGTCATCACTCTGACTGGAGTCCCTGCGTATTATCTCTTTATT  1404
            |.|||||||||||.||.||.|||.|.||.||..|.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1274  ACTCGGACCCATTCAGCACCGGGGTCGGTTTTCTTATCACCTTGACTGGGGTCCCTGCATATTATCTCTTCATT  1347

Query 1405  ATATGGGACAAGAAACCCAGGTGGTTTAGAATAATGTCAGAGAAAATAACCAGAACATTACAAATAATACTGGA  1478
            .||||||||||||||||||.||||||.|||..|.|.|||||.|.||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1348  GTATGGGACAAGAAACCCAAGTGGTTCAGACGATTATCAGACAGAATAACCAGAACATTACAGATTATACTAGA  1421

Query 1479  AGTTGTACCAGAAGA----AGATAAGTTA  1503
            |||||||||||||||    |.|.|| |||
Sbjct 1422  AGTTGTACCAGAAGACTCTAAAGAA-TTA  1449