Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02827
• Subject: NM_001305134.1
• Aligned Length: 1122
• Identities: 1036
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGTGCTGTGGGAGTCCCCGCGGCAGTGCAGCAGCTGGACACTTTGCGAGGGCTTTTGCTGGCTGCTGCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCTGTGGGAGTCCCCGCGGCAGTGCAGCAGCTGGACACTTTGCGAGGGCTTTTGCTGGCTGCTGCTGCT  74

Query   75  GCCCGTCATGCTACTCATCGTAGCCCGCCCGGTGAAGCTCGCTGCTTTCCCTACCTCCTTAAGTGACTGCCAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCGTCATGCTACTCATCGTAGCCCGCCCGGTGAAGCTCGCTGCTTTCCCTACCTCCTTAAGTGACTGCCAAA  148

Query  149  CGCCCACCGGCTGGAATTGCTCTGGTTATGATGACAGAGAAAATGATCTCTTCCTCTGTGACACCAACACCTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCCCACCGGCTGGAATTGCTCTGGTTATGATGACAGAGAAAATGATCTCTTCCTCTGTGACACCAACACCTGT  222

Query  223  AAATTTGATGGGGAATGTTTAAGAATTGGAGACACTGTGACTTGCGTCTGTCAGTTCAAGTGCAACAATGACTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAATTTGATGGGGAATGTTTAAGAATTGGAGACACTGTGACTTGCGTCTGTCAGTTCAAGTGCAACAATGACTA  296

Query  297  TGTGCCTGTGTGTGGCTCCAATGGGGAGAGCTACCAGAATGAGTGTTACCTGCGACAGGCTGCATGCAAACAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGCCTGTGTGTGGCTCCAATGGGGAGAGCTACCAGAATGAGTGTTACCTGCGACAGGCTGCATGCAAACAGC  370

Query  371  AGAGTGAGATACTTGTGGTGTCAGAAGGATCATGTGCCACAGATGCAGGATCAGGATCTGGAGATGGAGTCCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGTGAGATACTTGTGGTGTCAGAAGGATCATGTGCCACAGATGCAGGATCAGGATCTGGAGATGGAGTCCAT  444

Query  445  GAAGGCTCTGGAGAAACTAGTCAAAAGGAGACATCCACCTGTGATATTTGCCAGTTTGGTGCAGAATGTGACGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGGCTCTGGAGAAACTAGTCAAAAGGAGACATCCACCTGTGATATTTGCCAGTTTGGTGCAGAATGTGACGA  518

Query  519  AGATGCCGAGGATGTCTGGTGTGTGTGTAATATTGACTGTTCTCAAACCAACTTCAATCCCCTCTGCGCTTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATGCCGAGGATGTCTGGTGTGTGTGTAATATTGACTGTTCTCAAACCAACTTCAATCCCCTCTGCGCTTCTG  592

Query  593  ATGGGAAATCTTATGATAATGCATGCCAAATCAAAGAAGCATCGTGTCAGAAACAGGAGAAAATTGAAGTCATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGGAAATCTTATGATAATGCATGCCAAATCAAAGAAGCATCGTGTCAGAAACAGGAGAAAATTGAAGTCATG  666

Query  667  TCTTTGGGTCGATGTCAAGATAACACAACTACAACTACTAAGTCTGAAGATGGGCATTATGCAAGAACAGATTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTTTGGGTCGATGTCAAGATAACACAACTACAACTACTAAGTCTGAAGATGGGCATTATGCAAGAACAGATTA  740

Query  741  TGCAGAGAATGCTAACAAATTAGAAGAAAGTGCCAGAGAACACCACATACCTTGTCCGGAACATTACAATGGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAGAGAATGCTAACAAATTAGAAGAAAGTGCCAGAGAACACCACATACCTTGTCCGGAACATTACAATGGCT  814

Query  815  TCTGCATGCATGGGAAGTGTGAGCATTCTATCAATATGCAGGAGCCATCTTGCAGGTGTGATGCTGGTTATACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGCATGCATGGGAAGTGTGAGCATTCTATCAATATGCAGGAGCCATCTTGCAGGTGTGATGCTGGTTATACT  888

Query  889  GGACAACACTGTGAAAAAAAGGACTACAGTGTTCTATACGTTGTTCCCGGTCCTGTACGATTTCAGTATGTCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGACAACACTGTGAAAAAAAGGACTACAGTGTTCTATACGTTGTTCCCGGTCCTGTACGATTTCAGTATGTCTT  962

Query  963  AATCGCAGCTGTGATTGGAACAATTCAGATTGCTGTCATCTGTGTGGTGGTCCTCTGCATCACAAGGAAATGCC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || 
Sbjct  963  AATCGCAGCTGTGATTGGAACAATTCAGATTGCTGTCATCTGTGTGGTGGTCCTCTGCATCACAAGG----GC-  1031

Query 1037  CCAGAAGCAACAGAATTCACAGACAGAAGCAAAATACAGGGCACTACAGTTCAGACAATACAACAAGAGCGTCC  1110
                      ||.|.||                                                         
Sbjct 1032  ----------CAAACTT---------------------------------------------------------  1038

Query 1111  ACGAGGTTAATC  1122
                        
Sbjct 1039  ------------  1038