Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02827
• Subject: NM_019790.4
• Aligned Length: 1122
• Identities: 1049
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTGCTGTGGGAGTCCCCGCGGCAGTGCAGCAGCTGGACACTTTGCGAGGGCTTTTGCTGGCTGCTGCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCTGTGGGAGTCCCCGCGGCAGTGCAGCAGCTGGACACTTTGCGAGGGCTTCTGCTGGCTGCTGCTGCT  74

Query   75  GCCCGTCATGCTACTCATCGTAGCCCGCCCGGTGAAGCTCGCTGCTTTCCCTACCTCCTTAAGTGACTGCCAAA  148
            ||||||.|.|||.||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCGTGACGCTGCTTATCATAGCCCGCCCGGTAAAACTCGCTGCTTTCCCTACCTCCTTAAGTGACTGCCAAA  148

Query  149  CGCCCACCGGCTGGAATTGCTCTGGTTATGATGACAGAGAAAATGATCTCTTCCTCTGTGACACCAACACCTGT  222
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCCCACCGGCTGGAACTGCTCCGGTTACGATGACAGAGAAAATGATCTCTTCCTGTGTGACACCAACACCTGT  222

Query  223  AAATTTGATGGGGAATGTTTAAGAATTGGAGACACTGTGACTTGCGTCTGTCAGTTCAAGTGCAACAATGACTA  296
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct  223  AAATTTGACGGGGAATGTTTAAGGATTGGAGACACTGTGACTTGCGTCTGTCAGTTCAAGTGTAACAGTGACTA  296

Query  297  TGTGCCTGTGTGTGGCTCCAATGGGGAGAGCTACCAGAATGAGTGTTACCTGCGACAGGCTGCATGCAAACAGC  370
            .|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  CGTGCCTGTGTGTGGCTCCAATGGAGAGAGCTACCAGAATGAGTGCTACCTGAGGCAAGCTGCCTGCAAACAGC  370

Query  371  AGAGTGAGATACTTGTGGTGTCAGAAGGATCATGTGCCACAGATGCAGGATCAGGATCTGGAGATGGAGTCCAT  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGTGAGATACTTGTGGTCTCAGAAGGATCCTGTGCTACAGATACAGGATCGGGATCTGGAGATGGAGTCCAT  444

Query  445  GAAGGCTCTGGAGAAACTAGTCAAAAGGAGACATCCACCTGTGATATTTGCCAGTTTGGTGCAGAATGTGACGA  518
            |||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  GAAGGCTCTGGCGAGACCAGTCAGAAGGAGACATCCACCTGTGACATTTGCCAGTTTGGGGCAGAGTGTGATGA  518

Query  519  AGATGCCGAGGATGTCTGGTGTGTGTGTAATATTGACTGTTCTCAAACCAACTTCAATCCCCTCTGCGCTTCTG  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  AGATGCTGAGGATGTCTGGTGTGTGTGCAACATAGACTGTTCTCAAACCAACTTCAATCCCCTCTGTGCTTCTG  592

Query  593  ATGGGAAATCTTATGATAATGCATGCCAAATCAAAGAAGCATCGTGTCAGAAACAGGAGAAAATTGAAGTCATG  666
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGGAAATCTTATGATAATGCATGTCAAATCAAAGAAGCGTCATGTCAGAAACAGGAGAAAATTGAAGTCATG  666

Query  667  TCTTTGGGTCGATGTCAAGATAACACAACTACAACTACTAAGTCTGAAGATGGGCATTATGCAAGAACAGATTA  740
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTCTGGGTCGATGTCAAGATAACACAACTACAACCACTAAATCTGAAGATGGGCATTATGCAAGAACAGATTA  740

Query  741  TGCAGAGAATGCTAACAAATTAGAAGAAAGTGCCAGAGAACACCACATACCTTGTCCGGAACATTACAATGGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct  741  TGCAGAGAATGCTAACAAATTAGAAGAAAGTGCCAGAGAACACCACATACCTTGCCCAGAACATTATAATGGTT  814

Query  815  TCTGCATGCATGGGAAGTGTGAGCATTCTATCAATATGCAGGAGCCATCTTGCAGGTGTGATGCTGGTTATACT  888
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  TCTGCATGCATGGGAAGTGTGAACACTCCATCAATATGCAGGAGCCATCTTGCAGATGCGATGCTGGTTACACT  888

Query  889  GGACAACACTGTGAAAAAAAGGACTACAGTGTTCTATACGTTGTTCCCGGTCCTGTACGATTTCAGTATGTCTT  962
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  889  GGTCAACACTGTGAAAAGAAGGACTACAGTGTTCTCTACGTTGTTCCTGGCCCTGTCCGGTTCCAGTACGTCTT  962

Query  963  AATCGCAGCTGTGATTGGAACAATTCAGATTGCTGTCATCTGTGTGGTGGTCCTCTGCATCACAAGGAAATGCC  1036
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATTGCAGCTGTGATTGGAACAATTCAGATTGCTGTCATCTGCGTGGTGGTCCTCTGCATCACAAGGAAATGCC  1036

Query 1037  CCAGAAGCAACAGAATTCACAGACAGAAGCAAAATACAGGGCACTACAGTTCAGACAATACAACAAGAGCGTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1037  CCAGAAGCAACAGAATTCACAGACAGAAGCAAAATACAGGGCACTACAGTTCAGACAACACAACAAGAGCATCC  1110

Query 1111  ACGAGGTTAATC  1122
            ||..||||||||
Sbjct 1111  ACACGGTTAATC  1122