Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02827
• Subject: XM_017003739.2
• Aligned Length: 1122
• Identities: 1009
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGTGCTGTGGGAGTCCCCGCGGCAGTGCAGCAGCTGGACACTTTGCGAGGGCTTTTGCTGGCTGCTGCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCTGTGGGAGTCCCCGCGGCAGTGCAGCAGCTGGACACTTTGCGAGGGCTTTTGCTGGCTGCTGCTGCT  74

Query   75  GCCCGTCATGCTACTCATCGTAGCCCGCCCGGTGAAGCTCGCTGCTTTCCCTACCTCCTTAAGTGACTGCCAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCGTCATGCTACTCATCGTAGCCCGCCCGGTGAAGCTCGCTGCTTTCCCTACCTCCTTAAGTGACTGCCAAA  148

Query  149  CGCCCACCGGCTGGAATTGCTCTGGTTATGATGACAGAGAAAATGATCTCTTCCTCTGTGACACCAACACCTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCCCACCGGCTGGAATTGCTCTGGTTATGATGACAGAGAAAATGATCTCTTCCTCTGTGACACCAACACCTGT  222

Query  223  AAATTTGATGGGGAATGTTTAAGAATTGGAGACACTGTGACTTGCGTCTGTCAGTTCAAGTGCAACAATGACTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAATTTGATGGGGAATGTTTAAGAATTGGAGACACTGTGACTTGCGTCTGTCAGTTCAAGTGCAACAATGACTA  296

Query  297  TGTGCCTGTGTGTGGCTCCAATGGGGAGAGCTACCAGAATGAGTGTTACCTGCGACAGGCTGCATGCAAACAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGCCTGTGTGTGGCTCCAATGGGGAGAGCTACCAGAATGAGTGTTACCTGCGACAGGCTGCATGCAAACAGC  370

Query  371  AGAGTGAGATACTTGTGGTGTCAGAAGGATCATGTGCCACAGATGCAGGATCAGGATCTGGAGATGGAGTCCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           |||||||
Sbjct  371  AGAGTGAGATACTTGTGGTGTCAGAAGGATCATGTGCCAC---------------------------AGTCCAT  417

Query  445  GAAGGCTCTGGAGAAACTAGTCAAAAGGAGACATCCACCTGTGATATTTGCCAGTTTGGTGCAGAATGTGACGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  GAAGGCTCTGGAGAAACTAGTCAAAAGGAGACATCCACCTGTGATATTTGCCAGTTTGGTGCAGAATGTGACGA  491

Query  519  AGATGCCGAGGATGTCTGGTGTGTGTGTAATATTGACTGTTCTCAAACCAACTTCAATCCCCTCTGCGCTTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  AGATGCCGAGGATGTCTGGTGTGTGTGTAATATTGACTGTTCTCAAACCAACTTCAATCCCCTCTGCGCTTCTG  565

Query  593  ATGGGAAATCTTATGATAATGCATGCCAAATCAAAGAAGCATCGTGTCAGAAACAGGAGAAAATTGAAGTCATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  ATGGGAAATCTTATGATAATGCATGCCAAATCAAAGAAGCATCGTGTCAGAAACAGGAGAAAATTGAAGTCATG  639

Query  667  TCTTTGGGTCGATGTCAAGATAACACAACTACAACTACTAAGTCTGAAGATGGGCATTATGCAAGAACAGATTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  TCTTTGGGTCGATGTCAAGATAACACAACTACAACTACTAAGTCTGAAGATGGGCATTATGCAAGAACAGATTA  713

Query  741  TGCAGAGAATGCTAACAAATTAGAAGAAAGTGCCAGAGAACACCACATACCTTGTCCGGAACATTACAATGGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  TGCAGAGAATGCTAACAAATTAGAAGAAAGTGCCAGAGAACACCACATACCTTGTCCGGAACATTACAATGGCT  787

Query  815  TCTGCATGCATGGGAAGTGTGAGCATTCTATCAATATGCAGGAGCCATCTTGCAGGTGTGATGCTGGTTATACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  TCTGCATGCATGGGAAGTGTGAGCATTCTATCAATATGCAGGAGCCATCTTGCAGGTGTGATGCTGGTTATACT  861

Query  889  GGACAACACTGTGAAAAAAAGGACTACAGTGTTCTATACGTTGTTCCCGGTCCTGTACGATTTCAGTATGTCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GGACAACACTGTGAAAAAAAGGACTACAGTGTTCTATACGTTGTTCCCGGTCCTGTACGATTTCAGTATGTCTT  935

Query  963  AATCGCAGCTGTGATTGGAACAATTCAGATTGCTGTCATCTGTGTGGTGGTCCTCTGCATCACAAGGAAATGCC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || 
Sbjct  936  AATCGCAGCTGTGATTGGAACAATTCAGATTGCTGTCATCTGTGTGGTGGTCCTCTGCATCACAAGG----GC-  1004

Query 1037  CCAGAAGCAACAGAATTCACAGACAGAAGCAAAATACAGGGCACTACAGTTCAGACAATACAACAAGAGCGTCC  1110
                      ||.|.||                                                         
Sbjct 1005  ----------CAAACTT---------------------------------------------------------  1011

Query 1111  ACGAGGTTAATC  1122
                        
Sbjct 1012  ------------  1011