Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02842
• Subject: NM_001317232.1
• Aligned Length: 909
• Identities: 882
• Gaps: 27

Alignment

Query   1  ATGGCGGACGCGGCCAGTCAGGTGCTCCTGGGCTCCGGTCTCACCATCCTGTCCCAGCCGCTCATGTACGTGAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGGACGCGGCCAGTCAGGTGCTCCTGGGCTCCGGTCTCACCATCCTGTCCCAGCCGCTCATGTACGTGAA  74

Query  75  AGTGCTCATCCAGGTGGGATATGAGCCTCTTCCTCCAACAATAGGACGAAATATTTTTGGGCGGCAAGTGTGTC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGTGCTCATCCAGGTGGGATATGAGCCTCTTCCTCCAACAATAGGACGAAATATTTTTGGGCGGCAAGTGTGTC  148

Query 149  AGCTTCCTGGTCTCTTTAGTTATGCTCAGCACATTGCCAGTATCGATGGGAGGCGCGGGTTGTTCACAGGCTTA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGCTTCCTGGTCTCTTTAGTTATGCTCAGCACATTGCCAGTATCGATGGGAGGCGCGGGTTGTTCACAGGCTTA  222

Query 223  ACTCCAAGACTGTGTTCGGGAGTCCTTGGAACTGTGGTCCATGGTAAAGTTTTACAGCATTACCAGGAGAGTGA  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 223  ACTCCAAGACTGTGTTCGGGAGTCCTTGGAACTGTGGTCCATGGTAAAGTTTTAC-------------------  277

Query 297  CAAGGGTGAGGAGTTAGGACCTGGAAATGTACAGAAAGAAGTCTCATCTTCCTTTGACCACGTTATCAAGGAGA  370
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278  --------AGGAGTTAGGACCTGGAAATGTACAGAAAGAAGTCTCATCTTCCTTTGACCACGTTATCAAGGAGA  343

Query 371  CAACTCGAGAGATGATCGCTCGTTCTGCTGCTACCCTCATCACACATCCCTTCCATGTGATCACTCTGAGATCT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344  CAACTCGAGAGATGATCGCTCGTTCTGCTGCTACCCTCATCACACATCCCTTCCATGTGATCACTCTGAGATCT  417

Query 445  ATGGTACAGTTCATTGGCAGAGAATCCAAGTACTGTGGACTTTGTGATTCCATAATAACCATCTATCGGGAAGA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418  ATGGTACAGTTCATTGGCAGAGAATCCAAGTACTGTGGACTTTGTGATTCCATAATAACCATCTATCGGGAAGA  491

Query 519  GGGCATTCTAGGATTTTTCGCGGGTCTTGTTCCTCGCCTTCTAGGTGACATCCTTTCTTTGTGGCTGTGTAACT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492  GGGCATTCTAGGATTTTTCGCGGGTCTTGTTCCTCGCCTTCTAGGTGACATCCTTTCTTTGTGGCTGTGTAACT  565

Query 593  CACTGGCCTACCTCGTCAATACCTATGCACTGGACAGTGGGGTTTCTACCATGAATGAAATGAAGAGTTATTCT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566  CACTGGCCTACCTCGTCAATACCTATGCACTGGACAGTGGGGTTTCTACCATGAATGAAATGAAGAGTTATTCT  639

Query 667  CAAGCTGTCACAGGATTTTTTGCGAGTATGTTGACCTATCCCTTTGTGCTTGTCTCCAATCTTATGGCTGTCAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640  CAAGCTGTCACAGGATTTTTTGCGAGTATGTTGACCTATCCCTTTGTGCTTGTCTCCAATCTTATGGCTGTCAA  713

Query 741  CAACTGTGGTCTTGCTGGTGGATGCCCTCCTTACTCCCCAATATATACGTCTTGGATAGACTGTTGGTGCATGC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714  CAACTGTGGTCTTGCTGGTGGATGCCCTCCTTACTCCCCAATATATACGTCTTGGATAGACTGTTGGTGCATGC  787

Query 815  TACAAAAAGAGGGGAATATGAGCCGAGGAAATAGCTTATTTTTCCGGAAGGTCCCCTTTGGGAAGACTTATTGT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788  TACAAAAAGAGGGGAATATGAGCCGAGGAAATAGCTTATTTTTCCGGAAGGTCCCCTTTGGGAAGACTTATTGT  861

Query 889  TGTGACCTGAAAATGTTAATT  909
           |||||||||||||||||||||
Sbjct 862  TGTGACCTGAAAATGTTAATT  882