Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02860
• Subject: XM_011530110.2
• Aligned Length: 1269
• Identities: 927
• Gaps: 342

Alignment

Query    1  ATGGCAGGGAAAGTAAAATGGGTCACTGATATCGAGAAGTCAGTGCTGATCAATAACTTTGAAAAGAGAGGATG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTCCAAGTGACAGAAAACGAGGACTGGAATTTTTACTGGATGAGTGTGCAAACCATCCGAAATGTGTTCAGCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGAAGCTGGATATCGGCTCTCAGATGACCAAATAGTCAACCATTTTCCAAACCACTATGAACTGACCCGGAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACCTGATGGTGAAGAACATCAAAAGATACAGGAAGGAGCTGGAGAAAGAAGGGAGTCCTCTGGCAGAAAAAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGGACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTGTTTG  370
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGCTGCCCGCTGACTACAACCTGTTTG  28

Query  371  TAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGGCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  TAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGGCATC  102

Query  445  TTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTCAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  TTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTCAATC  176

Query  519  TAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGACCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  TAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGACCTGC  250

Query  593  GCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  GCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTTCTGC  324

Query  667  ACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCCAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  ACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCCAGAA  398

Query  741  ACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAGAGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  ACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAGAGCA  472

Query  815  CCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGCTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  CCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGCTGTG  546

Query  889  GCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGCTGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  GCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGCTGAA  620

Query  963  GCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAGTACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  GCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAGTACA  694

Query 1037  ACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTCGCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  ACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTCGCCA  768

Query 1111  CCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACCGGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  CCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACCGGGA  842

Query 1185  GCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTCCTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  GCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTCCTCA  916

Query 1259  CCACCTGGAAG  1269
            |||||||||||
Sbjct  917  CCACCTGGAAG  927