Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02903
Subject:
NM_001130969.1
Aligned Length:
1590
Identities:
1584
Gaps:
6

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCCCAGCATTAGGAAGCCCGCAGGCGAGGGCCCTCAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCCCAGCATTAGGAAGCCCGCAGGCGAGGGCCCTCAGCC  296

Query  297  TCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTGGCGGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTGGCGGTGG  370

Query  371  TGAAGGGGCGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGGTGGCAGCCGGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGGGGCGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGGTGGCAGCCGGGAG  444

Query  445  GACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCGGATGTGCCCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCGGATGTGCCCAGCT  518

Query  519  GGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCCGGTCGCCGCAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCCGGTCGCCGCAAGA  592

Query  593  AGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGTTCCCCAAGGAAAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGTTCCCCAAGGAAAAT  666

Query  667  CTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAG------CGGTGTTCAGGGGCTACGCGGAGAGGAAGCG  734
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCCATCTCGGTGTTCAGGGGCTACGCGGAGAGGAAGCG  740

Query  735  CCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGTCGGCAGCC  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGTCGGCAGCC  814

Query  809  GGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACCCCACCCCC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACCCCACCCCC  888

Query  883  ATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTGGACGAGGC  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTGGACGAGGC  962

Query  957  CTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTTCGTGCCAC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTTCGTGCCAC  1036

Query 1031  CAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGGATGACCCC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGGATGACCCC  1110

Query 1105  TCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAGAGGAAGCT  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAGAGGAAGCT  1184

Query 1179  GAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATC  1258

Query 1253  TCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTG  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTG  1332

Query 1327  AGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCC  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCC  1406

Query 1401  CAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGG  1480

Query 1475  AGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGC  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGC  1554

Query 1549  CAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1590